1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
...ttcagcgcaataattcgtgtttctagtcttacaatttctattgatttgctgtgaggcatgatttttcttctgttgttttactaaaatattttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACACCAAAGGCCGATTCCGTCTTCACTCAGTCATAGATGACGAGGCTAAG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA02G05370.1 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|192331395|gb|FK019896.1|FK019896
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|208332715|gb|GE130296.1|GE130296
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: ACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|298185233|gb|HO030446.1|HO030446
genomic: ACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|192330329|gb|FK019879.1|FK019879
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|207778559|gb|GD749360.1|GD749360
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|298186516|gb|HO037149.1|HO037149
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|6070919|gb|AW100306.1|AW100306
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|13480012|gb|BG509355.1|BG509355
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|207746121|gb|GD717847.1|GD717847
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|16996691|gb|BM086063.1|BM086063
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|254314706|gb|GR829699.1|GR829699
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|24205192|gb|BU964445.1|BU964445
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|14011931|gb|BG726853.1|BG726853
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|9564990|gb|BE474499.1|BE474499
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|298171206|gb|HO016238.1|HO016238
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|298169563|gb|HO020923.1|HO020923
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|209713029|gb|BW684323.1|BW684323
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|192306160|gb|FG995024.1|FG995024
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCCGTATGACAEST: gi|42723142|gb|CK769041.1|CK769041
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|7686422|gb|AW757070.1|AW757070
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAATACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|298185840|gb|HO031001.1|HO031001
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGA ATGTTGTATCAATCCCCAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|24136699|gb|BU927209.1|BU927209
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|209711384|gb|BW665355.1|BW665355
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|24205136|gb|BU964389.1|BU964389
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGCATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCCCCTGCTGTATGACAEST: gi|208304228|gb|GE104323.1|GE104323
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|298166568|gb|HO010007.1|HO010007
genomic: TCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCACCTGCTGTATGACAEST: gi|18730191|gb|BM525737.1|BM525737
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|37995318|gb|CF806907.1|CF806907
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|298172842|gb|HO019826.1|HO019826
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|298178096|gb|HO027479.1|HO027479
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|298185836|gb|HO030997.1|HO030997
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|9901739|gb|BE610707.1|BE610707
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|208057359|gb|GD850908.1|GD850908
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|18039968|gb|BM308262.1|BM308262
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|13479334|gb|BG508677.1|BG508677
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTACGCCTGCTGTTTGACAEST: gi|298165950|gb|HO008921.1|HO008921
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|298186477|gb|HO037110.1|HO037110
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|26058865|gb|CA801779.1|CA801779
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|24205206|gb|BU964459.1|BU964459
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|24135604|gb|BU926114.1|BU926114
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|193527298|gb|FK484208.1|FK484208
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|7232947|gb|AW568298.1|AW568298
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|18039341|gb|BM307635.1|BM307635
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|11413001|gb|BF425021.1|BF425021
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|23727082|gb|BU761559.1|BU761559
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|4397559|gb|AI496556.1|AI496556
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|16347113|gb|BI972708.1|BI972708
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|27425899|gb|CA937419.1|CA937419
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: ATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|33390170|gb|CA853377.1|CA853377
genomic: ATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|213596261|gb|DB960218.1|DB960218
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|193601367|gb|FK552632.1|FK552632
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|18040328|gb|BM308622.1|BM308622
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|298173423|gb|HO016759.1|HO016759
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|298169333|gb|HO020693.1|HO020693
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|15662189|gb|BI699560.1|BI699560
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|298184731|gb|HO029944.1|HO029944
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|193534913|gb|FK489077.1|FK489077
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|6567212|gb|AW234823.1|AW234823
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACAEST: gi|213602877|gb|DB972451.1|DB972451
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
EST: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGG ATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
genomic: TGTTGATGGCAAAGTCAGGACAGACAAGACATATCCTGCTGGTTTCATGGgtatgtaata ... ttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACA
ttgctgtgaggcatgatttttcttctgttgttttactaaaatattttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACACCAAAGGCCGATTCCGTCTTCACTCAGTCATAGATGACGAGGCTAAG
tactaaa putative branch site (score: 1)
tatttttttt CT-rich tract
atttttcttctgttgt TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ttcagcgcaataattcgtgtttctagtcttacaatttctattgatttgctgtgaggcatgatttttcttctgttgttttactaaaatattttttttgtagATGTTGTATCAATCCCTAAAACAAATGAGAACTTCCGCCTGCTGTATGACACCAAAGGCCGATTCCGTCTTCACTCAGTCATAGATGACGAGGCTAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ttgctgt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ggcatga