1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
gtatgatggtggctgagcttattctgatcactgttgttgactcagatggttttaatctaactaagactgtgtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAACTTTAATTGAAGCTCATGTGGATGTCAAGACCACTGATAATTATACGT
species | Glycine max |
transcript | GLYMA01G44700.1 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCEST: gi|208339955|gb|GE134019.1|GE134019
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCC
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|19453512|gb|BM954922.1|BM954922
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|254343531|gb|GR857287.1|GR857287
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|38193400|gb|CF922606.1|CF922606
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|15661981|gb|BI699352.1|BI699352
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|298168184|gb|HO013447.1|HO013447
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|4397560|gb|AI496557.1|AI496557
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|298191082|gb|HO038561.1|HO038561
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|5058165|gb|AI736641.1|AI736641
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|7232533|gb|AW567888.1|AW567888
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|16348775|gb|BI974370.1|BI974370
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|17153761|gb|BM143694.1|BM143694
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|26060090|gb|CA803004.1|CA803004
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|7233017|gb|AW568368.1|AW568368
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|192332525|gb|FK025630.1|FK025630
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|12773134|gb|BG238061.1|BG238061
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|192328074|gb|FK020377.1|FK020377
genomic: GGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|26058427|gb|CA801341.1|CA801341
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: TTTGAGAGCTGAGGATGTTNCAGGGGAAAA-TGTTCTGACAAACTTTTGN GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|192332152|gb|FK024598.1|FK024598
genomic: TTTGAGAGCTGAGGATGTT-CAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|17400321|gb|BM177103.1|BM177103
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|7685628|gb|AW756276.1|AW756276
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|12690078|gb|BG156414.1|BG156414
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|19269893|gb|BM886149.1|BM886149
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|14126294|gb|BG790732.1|BG790732
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: TTGAGAGCTGAGGATGTTTACAGG-AAAACA-GTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCEST: gi|10847434|gb|BF070121.1|BF070121
genomic: TTGAGAGCTGAGGATGTTCA-AGGGAAAA-ATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCC
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|6502115|gb|AW203488.1|AW203488
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTEST: gi|254337475|gb|GR845152.1|GR845152
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTT
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|193425799|gb|FK386950.1|FK386950
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGG-AAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|151393784|gb|EV263659.1|EV263659
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTTGGTGCGGAAATGGCAEST: gi|213599881|gb|DB973911.1|DB973911
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTT-GGTGCGGAAATGGCA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|7588555|gb|AW704278.1|AW704278
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|213616552|gb|DB967188.1|DB967188
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|8669050|gb|BE190152.1|BE190152
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|5058376|gb|AI736852.1|AI736852
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|31561066|gb|CD486904.1|CD486904
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|213611635|gb|DB969023.1|DB969023
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|298181845|gb|HO026020.1|HO026020
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTCCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|298182970|gb|HO028233.1|HO028233
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|38192220|gb|CF921426.1|CF921426
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|13252116|gb|BG363019.1|BG363019
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|19935243|gb|BQ080273.1|BQ080273
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTTTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|9901452|gb|BE610420.1|BE610420
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|213595543|gb|DB968507.1|DB968507
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTT-AGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|193472352|gb|FK438601.1|FK438601
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|17153668|gb|BM143601.1|BM143601
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|192318967|gb|FK010587.1|FK010587
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|14011865|gb|BG726787.1|BG726787
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGTGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|192295006|gb|FG986725.1|FG986725
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|6913653|gb|AW395183.1|AW395183
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|24136812|gb|BU927322.1|BU927322
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|37995820|gb|CF807409.1|CF807409
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAEST: gi|192325439|gb|FK017195.1|FK017195
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
EST: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGG GGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
genomic: GTTTGAGAGCTGAGGATGTTCAAGGGAAAAATGTTCTGACAAACTTTTGGgtatgatggt ... gtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAA
gatcactgttgttgactcagatggttttaatctaactaagactgtgtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAACTTTAATTGAAGCTCATGTGGATGTCAAGACCACTGATAATTATACGT
atctaac putative branch site (score: 2)
tgtcttt putative PPT
ttttaatctaactaa TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| gtatgatggtggctgagcttattctgatcactgttgttgactcagatggttttaatctaactaagactgtgtctttgtagGGAATGGATTTCACAACTGATAAGTTGAGGTCCTTGGTGCGGAAATGGCAAACTTTAATTGAAGCTCATGTGGATGTCAAGACCACTGATAATTATACGT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGAAGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTCA