1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
gtatgtcacacactgttaattctcaatacaatatcgtttttttttgtgggataattttttgttgtttgattttttaagtttgagacattgttgcttacggcttgccttatcgtgtagGAAATGGAAGCCACCGTTGTCGATGGTAACGGAACAGAGACCGGACATATTATTGTTACTACCATTGGGGGTAGAAATGGTCAACCGAAGCAG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA19G41420.3 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTGATAGGTTGCCAGAGGAGATGAATGATATGAGAATTAGGGATGATAAA GAAATGGAAGCCACCGTTGTCGATGGTAACGGAACAGAGACCGGACATATTEST: gi|208110039|gb|GD904509.1|GD904509
genomic: TTGATAGGTTGCCAGAGGAGATGAATGATATGAGAATTAGGGATGATAAAgtatgtcaca ... tatcgtgtagGAAATGGAAGCCACCGTTGTCGATGGTAACGGAACAGAGACCGGACATATT
EST: TTGATAGGCTGCCAGAGGAGATGAATGATATGAGAATTAGGGATGATAAA GAAATGGAAGCCACCGTTEST: gi|254328746|gb|GR833118.1|GR833118
genomic: TTGATAGGTTGCCAGAGGAGATGAATGATATGAGAATTAGGGATGATAAAgtatgtcaca ... tatcgtgtagGAAATGGAAGCCACCGTT
EST: TTGATAGGTTGCCAGAGGAGATGAATGATATGAGAATTAGGGATGATAAA GAAATGGAAGCCACCGTTGTCGATGGTAACGGAACAGAGACCGGACATATTEST: gi|27809424|gb|CB063846.1|CB063846
genomic: TTGATAGGTTGCCAGAGGAGATGAATGATATGAGAATTAGGGATGATAAAgtatgtcaca ... tatcgtgtagGAAATGGAAGCCACCGTTGTCGATGGTAACGGAACAGAGACCGGACATATT
EST: TTGATAGGTTGCCAGAGGAGATGAATGATATGAGAATTAGGGATGATAAA GAAATGGAAGCCACCGTTGTCGATGGTAACGGAACAGAGACCGGACATATTEST: gi|209725616|gb|BW663105.1|BW663105
genomic: TTGATAGGTTGCCAGAGGAGATGAATGATATGAGAATTAGGGATGATAAAgtatgtcaca ... tatcgtgtagGAAATGGAAGCCACCGTTGTCGATGGTAACGGAACAGAGACCGGACATATT
EST: TTGATAGGTTGCCAGAGGAGATGAATGATATGAGAATTAGGGATGATAAA GAAATGGAAGCCACCGTTGTCGATGGTAACGGAACAGAGACCGGACATATTEST: gi|6913877|gb|AW395407.1|AW395407
genomic: TTGATAGGTTGCCAGAGGAGATGAATGATATGAGAATTAGGGATGATAAAgtatgtcaca ... tatcgtgtagGAAATGGAAGCCACCGTTGTCGATGGTAACGGAACAGAGACCGGACATATT
EST: TTGATAGGTTGCCAGAGGAGATGAATGATATGAGAATTAGGGATGATAAA GAAATGGAAGCCACCGTTGTCGATGGTAACGGAACAGAGACCGGACATATTEST: gi|213591319|gb|DB973808.1|DB973808
genomic: TTGATAGGTTGCCAGAGGAGATGAATGATATGAGAATTAGGGATGATAAAgtatgtcaca ... tatcgtgtagGAAATGGAAGCCACCGTTGTCGATGGTAACGGAACAGAGACCGGACATATT
EST: TTGATAGGTTGCCAGAGGAGATGAATGATATGAGAATTAGGGATGATAAA GAAATGGAAGCCACCGTTGTCGATGGTAACGGAACAGAGACCGGACATATTEST: gi|298165875|gb|HO008846.1|HO008846
genomic: TTGATAGGTTGCCAGAGGAGATGAATGATATGAGAATTAGGGATGATAAAgtatgtcaca ... tatcgtgtagGAAATGGAAGCCACCGTTGTCGATGGTAACGGAACAGAGACCGGACATATT
EST: TTGATAGGTTGCCAGAGGAGATGAATGATATGAGAATTAGGGATGATAAA GAAATGGAAGCCACCGTTGTCGATGGTAACGGAACAGAGACCGGACATATTEST: gi|208285521|gb|GE082457.1|GE082457
genomic: TTGATAGGTTGCCAGAGGAGATGAATGATATGAGAATTAGGGATGATAAAgtatgtcaca ... tatcgtgtagGAAATGGAAGCCACCGTTGTCGATGGTAACGGAACAGAGACCGGACATATT
EST: TTGATAGGTTGCCAGAGGAGATGAATGATATGAGAATTAGGGATGATAAA GAAATGGAAGCCACCGTTGTCGATGGTAACGGAACAGAGACCGGACATATT
genomic: TTGATAGGTTGCCAGAGGAGATGAATGATATGAGAATTAGGGATGATAAAgtatgtcaca ... tatcgtgtagGAAATGGAAGCCACCGTTGTCGATGGTAACGGAACAGAGACCGGACATATT
tgtttgattttttaagtttgagacattgttgcttacggcttgccttatcgtgtagGAAATGGAAGCCACCGTTGTCGATGGTAACGGAACAGAGACCGGACATATTATTGTTACTACCATTGGGGGTAGAAATGGTCAACCGAAGCAG
tgcttac putative branch site (score: 2)
cttgcctt putative PPT
attttttaagtttga TA-rich tract