1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
...actagaaaataaaccacagagattcatatttaatcacatgttatgaatatttgaggtcaacaatgtctaggaaaccaatttaaatgaaattgttgtgcagGGCTCACAAAAAGCTTTCATCCGTTTCTGCATGGGAAAACAGCAAGAAAGCTGCTGTGGAGGCTGACCTGAAAAAGATTGAA
species | Glycine max |
transcript | GLYMA16G31290.2 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
aatatttgaggtcaacaatgtctaggaaaccaatttaaatgaaattgttgtgcagGGCTCACAAAAAGCTTTCATCCGTTTCTGCATGGGAAAACAGCAAGAAAGCTGCTGTGGAGGCTGACCTGAAAAAGATTGAA
aatttaaatgaaattg TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| actagaaaataaaccacagagattcatatttaatcacatgttatgaatatttgaggtcaacaatgtctaggaaaccaatttaaatgaaattgttgtgcagGGCTCACAAAAAGCTTTCATCCGTTTCTGCATGGGAAAACAGCAAGAAAGCTGCTGTGGAGGCTGACCTGAAAAAGATTGAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GTGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGG
- -agaaaata
- - - - - -aaccaca
- - - - - - - - - - - - - - - - - cacatgt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - caatgtc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gaaaccaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -aaatgaaa