1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtgagttatcctttaaactaattatgattccaattgggttttgaatggtttttgagttcagaattgggtgagttgtttgtgaattttgagtgttagattcaagtattcaactgggtatgtctgattttcagGTGGGTATGGAATTTTGGGCTAGATGGGCTCATAGGGCTCTCTGGCATGCTTCGCTGTGGCACATGCATGAG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA16G29790.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TGCCTTGGTCTGAAATGTTTGGCACATTTGCTCTATCAGTGGGAGCTGCT GTGGGTATGGAATTTTGGGCTAGATGGGCTCATAGGGCTCTCTGGCATGCTEST: gi|10256359|gb|BE824125.1|BE824125
genomic: TGCCTTGGTCTGAAATGTTTGGCACATTTGCTCTATCAGTGGGAGCTGCTgtgagttatc ... tgattttcagGTGGGTATGGAATTTTGGGCTAGATGGGCTCATAGGGCTCTCTGGCATGCT
EST: TGCCTTGGNCTGAAATGTTTGGCACATTTGCTCTATCAGTGGGAGCTGCT GTGGGTATGGAATTTTGGGCTAGATGGGCTCATAGGGCTCTCTGGCATGCTEST: gi|31471135|gb|CD413163.1|CD413163
genomic: TGCCTTGGTCTGAAATGTTTGGCACATTTGCTCTATCAGTGGGAGCTGCTgtgagttatc ... tgattttcagGTGGGTATGGAATTTTGGGCTAGATGGGCTCATAGGGCTCTCTGGCATGCT
EST: CTTGGTCTGAAATGTTTGGCACATTTGCTCTATCAGTGGGAGCTGCT GTGGGTATGGAATTTTGGGCTAGATGGGCTCATAGGGCTCTCTGGCATGCT
genomic: CTTGGTCTGAAATGTTTGGCACATTTGCTCTATCAGTGGGAGCTGCTgtgagttatc ... tgattttcagGTGGGTATGGAATTTTGGGCTAGATGGGCTCATAGGGCTCTCTGGCATGCT
ttgtgaattttgagtgttagattcaagtattcaactgggtatgtctgattttcagGTGGGTATGGAATTTTGGGCTAGATGGGCTCATAGGGCTCTCTGGCATGCTTCGCTGTGGCACATGCATGAG
gtctgat putative branch site (score: 4)
ttttc CT-rich tract
aattttga TA-rich tract