1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
gttcgttggttaaatatttcgttataagtgcataggaattaggatctttttttttttgctgacaaaaatatatttttatttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGCATGTCTCCCAACACGCTATTAAGGTTA
species | Glycine max |
transcript | GLYMA15G05670.2 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|192303123|gb|FG994241.1|FG994241
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|31467235|gb|CD409263.1|CD409263
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACCAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|208118739|gb|GD919682.1|GD919682
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGEST: gi|18041170|gb|BM309455.1|BM309455
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|151412143|gb|EV281955.1|EV281955
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|163928775|gb|EH038599.1|EH038599
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|208062287|gb|GD857635.1|GD857635
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGEST: gi|6847594|gb|AW349803.1|AW349803
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|192298522|gb|FG989213.1|FG989213
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|58014790|gb|CX701532.1|CX701532
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|208106267|gb|GD903298.1|GD903298
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|5761219|gb|AI966582.1|AI966582
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCTTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|21602280|gb|BQ612602.1|BQ612602
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|15815644|gb|BI787919.1|BI787919
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|151398638|gb|EV268509.1|EV268509
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|298197799|gb|HO039338.1|HO039338
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|193521346|gb|FK478595.1|FK478595
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTEST: gi|31464065|gb|CD406093.1|CD406093
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTT
EST: GCATACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|58024233|gb|CX710974.1|CX710974
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|4313639|gb|AI460758.1|AI460758
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|58015097|gb|CX701839.1|CX701839
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAATTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|192332711|gb|FK025368.1|FK025368
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCATGGTTGCAAGEST: gi|31311850|gb|CD397053.1|CD397053
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|31468057|gb|CD410085.1|CD410085
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|151409643|gb|EV279451.1|EV279451
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|18848936|gb|BM568046.1|BM568046
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|208172807|gb|GD972042.1|GD972042
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|7691471|gb|AW759598.1|AW759598
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|58014502|gb|CX701244.1|CX701244
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|6747108|gb|AW317564.1|AW317564
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|24135500|gb|BU926010.1|BU926010
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|16280944|gb|BI944229.1|BI944229
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|192303122|gb|FG994240.1|FG994240
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGEST: gi|208134996|gb|GD928771.1|GD928771
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
EST: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAG GCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
genomic: GCAAACAATCCGGTTATGGTGGACAAACTAAGCCCGTCTTCCACAAGAAGgttcgttggt ... tttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAG
aggaattaggatctttttttttttgctgacaaaaatatatttttatttaaaatagGCTAAAACCACCAAGAAGATTGTTCTGAGGTTGCAATGCCAGGGTTGCAAGCATGTCTCCCAACACGCTATTAAGGTTA
tgctgac putative branch site (score: 2)
tttttattt putative PPT
tttttttttttgctga TA-rich tract