1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
...agttatatgctattggctatatataacctatactcaatattattctttttcagctaaaaatgtaaaaggtagctgaaactttcttgtttgaaactttcagGCCATGGTGGTGCTCGTGCTGCTGAGTATGTCAAGCAAAACCTATTTAGCAATTTGATCAGTCATCCAAAATTCATTTCTGACACCAAATCTGCAATAG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA14G12220.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AATTGATGGTGTGGATGGTGAAATTGTTGGCCTTTTTGGAGTTTTTGATG GCCATGGTGGTGCTCGTGCTGCTGAGTATGTCAAGCAAAACCTATTTAGCAEST: gi|213597178|gb|DB968217.1|DB968217
genomic: AATTGATGGTGTTGATGGTGAAATTGTTGGCCTTTTTGGAGTTTTTGATGgtatatttac ... aaactttcagGCCATGGTGGTGCTCGTGCTGCTGAGTATGTCAAGCAAAACCTATTTAGCA
EST: AATTGATGGTGTTGATGGTGAAATTGTTGGCCTTTTTGGAGTTTTTGATG GCCATGGTGGTGCTCGTGCTGCTGAGTATGTCAAGCAAAACCTATTTAGCAEST: gi|6502191|gb|AW203564.1|AW203564
genomic: AATTGATGGTGTTGATGGTGAAATTGTTGGCCTTTTTGGAGTTTTTGATGgtatatttac ... aaactttcagGCCATGGTGGTGCTCGTGCTGCTGAGTATGTCAAGCAAAACCTATTTAGCA
EST: AATTGATGGTGTTGATGGTGAAATTGTTGGCCTTTTTGGAGTTTTTGATG GCCATGGTGGTGCTCGTGCTGCTGAGTATGTCAAGCAAAACCTATTTAGCA
genomic: AATTGATGGTGTTGATGGTGAAATTGTTGGCCTTTTTGGAGTTTTTGATGgtatatttac ... aaactttcagGCCATGGTGGTGCTCGTGCTGCTGAGTATGTCAAGCAAAACCTATTTAGCA
tttttcagctaaaaatgtaaaaggtagctgaaactttcttgtttgaaactttcagGCCATGGTGGTGCTCGTGCTGCTGAGTATGTCAAGCAAAACCTATTTAGCAATTTGATCAGTCATCCAAAATTCATTTCTGACACCAAATCTGCAATAG
agctaaa putative branch site (score: 3)
ctttc putative PPT
taaaaatgtaaaa TA-rich tract