1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
gttgatcaactacatttgtctgtaaatttctcatgatgttggtggttatttattggatgcaatttgtgtgaaaccaacaaaaatgttagtcctggtttataatgcactgttctatggggacttatttgttcattttacaaataattgcattaatggtcattctaggttaaaaagttgaatttacacatgcagGTAGAGGGGATTTTCAGAATTAACGCGGACAATGGTCAAGAGGAACATGCTAGGGATCAATTGAATTTGGGAGTGGTCCCAGAAGGCATCGATGTACATT
species | Glycine max |
transcript | GLYMA13G39230.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CAATTCTGCTGTTGATGCAAAAGCATTTGTATGTTCAAGGAGGTTTGCAG GTAGAGGGGATTTTCAGAATTAACGCGGACAATGGTCAAGAGGAACATGCT
genomic: CAATTCTGCTGTTGATGCAAAAGCATTTGTATGTTCAAGGAGGTTTGCAGgttgatcaac ... acacatgcagGTAGAGGGGATTTTCAGAATTAACGCGGACAATGGTCAAGAGGAACATGCT
caaataattgcattaatggtcattctaggttaaaaagttgaatttacacatgcagGTAGAGGGGATTTTCAGAATTAACGCGGACAATGGTCAAGAGGAACATGCTAGGGATCAATTGAATTTGGGAGTGGTCCCAGAAGGCATCGATGTACATT
cattaat putative branch site (score: 3)
ttaaaaagttgaattt TA-rich tract