1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
gtaagattttttgtttttgtttttatctttcttctgagcaatctggttttattattactgaaacgttcttgttttgtgtcgaatatgattgcaacaggatgatgttaatgttatctgttaaattttaattaatggccttatcttcttttttttccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGATAGTTTTGACGCTATGGGTTTGCAGGAAAATCTTCTCAGGGGAATTTAC
species | Glycine max |
transcript | GLYMA13G16570.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT ACTTTCATCCGATGGACAGGACTTCTTCEST: gi|209702283|gb|BW677978.1|BW677978
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTC
EST: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGAEST: gi|213611789|gb|DB958883.1|DB958883
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
EST: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGAEST: gi|18848532|gb|BM567716.1|BM567716
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
EST: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGAEST: gi|192324821|gb|FK018797.1|FK018797
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
EST: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGAEST: gi|213599313|gb|DB962322.1|DB962322
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
EST: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGAEST: gi|209702379|gb|BW656354.1|BW656354
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
EST: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGAEST: gi|10846840|gb|BF071428.1|BF071428
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
EST: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGAEST: gi|213590331|gb|DB970129.1|DB970129
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
EST: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGAEST: gi|209710996|gb|BW681346.1|BW681346
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
EST: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGAEST: gi|213600814|gb|DB968820.1|DB968820
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
EST: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGAEST: gi|16349138|gb|BI974733.1|BI974733
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
EST: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGAEST: gi|213607320|gb|DB965150.1|DB965150
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
EST: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGAEST: gi|7686567|gb|AW757215.1|AW757215
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
EST: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTT ACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
genomic: GAGGGATCACAGTTCGATGCTCGTCAATATGATTCTAAAATGAGTGACTTgtaagatttt ... tccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGA
atgttatctgttaaattttaattaatggccttatcttcttttttttccctttcagACTTTCATCTGATGGACAGGACTTCTTCACATCCTATGACGAGGTTTATGATAGTTTTGACGCTATGGGTTTGCAGGAAAATCTTCTCAGGGGAATTTAC
aattaat putative branch site (score: 3)
tggccttatcttcttt CT-rich tract
atctgttaaattttaa TA-rich tract