1 5' 3' | 2 5' 3' |
gtaatattatgttgtttatttaattggttcatcgatatatatatatatagatatatgtcattttgattgtgttgatgatggattttgggattgaatggatcagCATGCGGTGGAGAATGGAGCGGTGGCGGTGAGCGAGCCTGAGCTGAAGGAGTGGGGACAGAAGGTTGGGTACGTCAGAGATATTGACGGCAACGTTGTGA
species | Glycine max |
transcript | GLYMA12G06970.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CACCCATGGAGGTTTGTTTTGTTTACTCTGACGTTGATGCTGCTTACAAG CATGCGGTGGAGAATGGAGCGGTGGCGGTGAGCGAGCCTGAGCTGAAGGAGEST: gi|11689141|gb|BF596817.1|BF596817
genomic: CACCCATGGAGGTTTGTTTTGTTTACTCTGACGTTGATGCTGCTTACAAGgtaatattat ... aatggatcagCATGCGGTGGAGAATGGAGCGGTGGCGGTGAGCGAGCCTGAGCTGAAGGAG
EST: CACCCATGGAGGTTTGTTTTGTTTACTCTGACGTTGATGCTGCTTACAAG CATGCGGTGGAGAATGGAGCGGTGGCGGTGAGCGAGCCTGAGCTGAAGGAGEST: gi|10254321|gb|BE822087.1|BE822087
genomic: CACCCATGGAGGTTTGTTTTGTTTACTCTGACGTTGATGCTGCTTACAAGgtaatattat ... aatggatcagCATGCGGTGGAGAATGGAGCGGTGGCGGTGAGCGAGCCTGAGCTGAAGGAG
EST: CACCCATGGAGGTTTGTTTTGTTTACTCTGACGTTGATGCTGCTTACAAG CATGCGGTGGAGAATGGAGCGGTNNCGGTGAGCGAGCCNGNGCTGAAGGAGEST: gi|298169522|gb|HO020882.1|HO020882
genomic: CACCCATGGAGGTTTGTTTTGTTTACTCTGACGTTGATGCTGCTTACAAGgtaatattat ... aatggatcagCATGCGGTGGAGAATGGAGCGGTGGCGGTGAGCGAGCCTGAGCTGAAGGAG
EST: CACCCATGGAGGTTTGTTTTGTTTACTCTGACGTTGATGCTGCTTACAAG CATGCGGTGGAGAATGGAGCGGTGGCGGTGAGCGAGCCTGAGCTGAAGGAGEST: gi|298174865|gb|HO014782.1|HO014782
genomic: CACCCATGGAGGTTTGTTTTGTTTACTCTGACGTTGATGCTGCTTACAAGgtaatattat ... aatggatcagCATGCGGTGGAGAATGGAGCGGTGGCGGTGAGCGAGCCTGAGCTGAAGGAG
EST: CACCCATGGAGGTTTGTTTTGTTTACTCTGACGTTGATGCTGCTTACAAG CATGCGGTGGAGAATGGAGCGGTGGCGGTGTGCGAGCCTGAGCTGAAGGAGEST: gi|163918333|gb|EH039927.1|EH039927
genomic: CACCCATGGAGGTTTGTTTTGTTTACTCTGACGTTGATGCTGCTTACAAGgtaatattat ... aatggatcagCATGCGGTGGAGAATGGAGCGGTGGCGGTGAGCGAGCCTGAGCTGAAGGAG
EST: CACCCATGGAGGTTTGTTTTGTTTACTCTGGCGTTGATGCTGCTTACAAG CATGCGGTGGAGAATGGAGCGGTGGCGGTGAGCGAGCCTGAGCTGAAGGAGEST: gi|298164154|gb|HO013799.1|HO013799
genomic: CACCCATGGAGGTTTGTTTTGTTTACTCTGACGTTGATGCTGCTTACAAGgtaatattat ... aatggatcagCATGCGGTGGAGAATGGAGCGGTGGCGGTGAGCGAGCCTGAGCTGAAGGAG
EST: CACCCATGGAGGTTTGTTTTGTTTACTCTGACGTTGATGCTGCTTACAAG CATGCGGTGGAGAATGGAGCGGTGGCGGTGGGCGAGCCTGAGCTGAAGGAGEST: gi|298198347|gb|HO039886.1|HO039886
genomic: CACCCATGGAGGTTTGTTTTGTTTACTCTGACGTTGATGCTGCTTACAAGgtaatattat ... aatggatcagCATGCGGTGGAGAATGGAGCGGTGGCGGTGAGCGAGCCTGAGCTGAAGGAG
EST: CACCCATGGAGGTTTGTTTTGTTTACTCTGACGTTGATGCTGCTTACAAG CATGCGGTGGAGAATGGAGCGGTGGCGGTGEST: gi|298164038|gb|HO013683.1|HO013683
genomic: CACCCATGGAGGTTTGTTTTGTTTACTCTGACGTTGATGCTGCTTACAAGgtaatattat ... aatggatcagCATGCGGTGGAGAATGGAGCGGTGGCGGTG
EST: CACCCATGGAGGTTTGTTTTGTTTACTCTGACGTTGATGCTGCTTACAAG CACGCGGTGGAGAATGGAGCGGTGGCGGTGAGCGAGCCTGAGCTGAAGGAGEST: gi|6455464|gb|AW186147.1|AW186147
genomic: CACCCATGGAGGTTTGTTTTGTTTACTCTGACGTTGATGCTGCTTACAAGgtaatattat ... aatggatcagCATGCGGTGGAGAATGGAGCGGTGGCGGTGAGCGAGCCTGAGCTGAAGGAG
EST: CACCCATGGAGGTTTGTTTTGTTTACTCTGACGTTGATGCTGCTTACAAG CATGCGGTGGAGAATGGAGCGGTGGCGGTGAGCGAGCCTGAGCTGAAGGAG
genomic: CACCCATGGAGGTTTGTTTTGTTTACTCTGACGTTGATGCTGCTTACAAGgtaatattat ... aatggatcagCATGCGGTGGAGAATGGAGCGGTGGCGGTGAGCGAGCCTGAGCTGAAGGAG
agatatatgtcattttgattgtgttgatgatggattttgggattgaatggatcagCATGCGGTGGAGAATGGAGCGGTGGCGGTGAGCGAGCCTGAGCTGAAGGAGTGGGGACAGAAGGTTGGGTACGTCAGAGATATTGACGGCAACGTTGTGA
tgttgat putative branch site (score: 4)
attttgatt TA-rich tract