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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...caaaatatttcatcatcttctatatgctttagtttccttccatgttttatttgggtgatatgcgacttgtgtgattttctgaattctataccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCATCGTGCTGGCAAATTCGAAGCCAAATTCTTTGACAAG

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA09G36870.1
intron # 2
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA09G36870.1 (Glycine max), 3'ss of exon 2
lower sequence: LOC_Os11g39300.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 2
caaaatatttcatc----atctt-ctatatgctttagtttccttccatgttttatttgggtgatatgcgacttgtgtgattttctgaattctataccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCATCGTGCTGGCAAATTCGAAGCCAAATTCTTTGACAAG
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ctgaattgttcacctgagatgttactgtaacgagtagtcagct--catcttgt-tcccattcctattctaactac-taatcacaagaattcttcgttgtgt-tagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAAGATGCTATGAATGTGACTATGACAAACTGTCTTGCAGGAAAATTTGAACCGAAGTTCTTTCACAAG

upper sequence: GLYMA09G36870.1 (Glycine max), 3'ss of exon 2
lower sequence: LOC_Os08g21660.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 4
caaaatatttcatcatctt-ctatatgctttagtttccttccatgttttatttgggtgatatgcgacttg---tgtgattttctgaattctataccttgtgt-agGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCATCGTGCTGGCAAATTCGAAGCCAAATTCTTTGACAAG
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-----agttccacaatgttgctaggtagttgaatgaaatattatattgcttatggaccacttttggactacattgtggatgccctaagaaatcttgttgtgttagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAAGATGCGATGAATGTGACTATGACAGATCGTCGTGCAGGAAAATTTGAAGCGAAATTTTTTCACAAG

upper sequence: GLYMA09G36870.1 (Glycine max), 3'ss of exon 2
lower sequence: AT2G46280.1 (Arabidopsis thaliana), 3'ss of exon 5
caaaatatttcatcatcttctatatgctttagtttcct-tccatgttttatttgggtgatatgcgacttgtgtgattttctgaattctataccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCATCGTGCTGGCAAATTCGAAGCCAAATTCTTTGACAAG
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----gtatgcactaatgcttcatgaaattcaatttcgaatcccagaatcagcaaggcatgatgttatctttgtgaatgtttctgctct----ctcttttagGTTGTACTTGGAGGTGGTCAAGATGCATCAGCTGTGACTACCACTGATCATCGTGCTGGAAAGTTTGAAGCTAAGTTTTACGACAAG

upper sequence: GLYMA09G36870.1 (Glycine max), 3'ss of exon 2
lower sequence: AT2G46290.1 (Arabidopsis thaliana), 3'ss of exon 6
caaaatatttcatcat-cttctatatgctttagtttccttccatgttttatttgggtgatatgcgacttgtgtgattttctgaattctataccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCATCGTGCTGGCAAATTCGAAGCCAAATTCTTTGACAAG
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----gtatgcactaatgcttcttgaaattcaaattcggttcccaaaagcaacaagtcttgatgttatctttgtgaatgtttctgctctcgctctttt--agGTTGTGCTTGGAGGTGGTCAAGATGCATCAGCTGTGACTACCACTGATCATCGTGCTGGGAAGTTTGAAGCTAAGTTTTACGACACG

upper sequence: GLYMA09G36870.1 (Glycine max), 3'ss of exon 2
lower sequence: Vv01s0011g06630.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 5
caaaatatttcatcatcttc--tatatgctttagtttccttccatgttttatttgggtgat-atgcgacttgtgtgattttctgaattctataccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCATCGTGCTGGCAAATTCGAAGCCAAATTCTTTGACAAG
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---tatacttacatgtgttgggtatataaatttacagatggtggaaatagatatcgctgattgttcatgctgtttctaactttgattcttttgtgttctccagGTAGTACTAGGAGGTGGTCAAGATGCATCACATGTCACAACAACTGATCATCGTGCTGGAAAGTTTGAGGCAAAATTCTATGATAAG

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|193638200|gb|FK586694.1|FK586694
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
EST: gi|207781425|gb|GD752786.1|GD752786
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGACCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCCGTTACAACTACTGATCAT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
EST: gi|208182074|gb|GD979429.1|GD979429
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
EST: gi|208076143|gb|GD875198.1|GD875198
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTCCTTGATCAT                         GTGGTTATTGG
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGG
EST: gi|207760801|gb|GD734124.1|GD734124
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
EST: gi|208085820|gb|GD882424.1|GD882424
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGG
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGG
EST: gi|193324290|gb|FK288832.1|FK288832
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
EST: gi|7639005|gb|AW733337.1|AW733337
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
EST: gi|208253948|gb|GE055954.1|GE055954
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCT
EST: gi|208263864|gb|GE065272.1|GE065272
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
EST: gi|57575042|gb|CX548017.1|CX548017
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
EST: gi|193524469|gb|FK483096.1|FK483096
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
EST: gi|193565006|gb|FK520149.1|FK520149
EST:     ACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATTCTAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCA
genomic: ACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGA-TC-ATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCA
EST: gi|193640568|gb|FK587605.1|FK587605
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAG
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAG
EST: gi|193604344|gb|FK558973.1|FK558973
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
EST: gi|193457340|gb|FK421916.1|FK421916
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAAACTAAACTAGA
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAA-CTA--CT-GA
EST: gi|207705762|gb|GD686838.1|GD686838
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
EST: gi|208080480|gb|GD877214.1|GD877214
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
EST: gi|208312177|gb|GE109917.1|GE109917
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
EST: gi|193494975|gb|FK463635.1|FK463635
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGG
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGG
EST: gi|208279826|gb|GE078456.1|GE078456
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
EST: gi|193681622|gb|FK624562.1|FK624562
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
EST: gi|120495908|gb|EH224075.1|EH224075
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
EST: gi|193324427|gb|FK292665.1|FK292665
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGTATGCCTCAGCTGTTTACAACTACTGATC
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGG-ATGCCTCAGCTGTT-ACAACTACTGATC
EST: gi|298193520|gb|HO034126.1|HO034126
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
EST: gi|208207188|gb|GE003763.1|GE003763
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGA
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGA
EST: gi|207715870|gb|GD699318.1|GD699318
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
EST: gi|207692197|gb|GD675374.1|GD675374
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGACGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
EST: gi|193708111|gb|FK642445.1|FK642445
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGG
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGG
EST: gi|207811262|gb|GD784723.1|GD784723
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGGTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGG
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGG
EST: gi|208093809|gb|GD896110.1|GD896110
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGG
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGG
EST: gi|208102732|gb|GD897473.1|GD897473
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
EST: gi|207774647|gb|GD747171.1|GD747171
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
EST: gi|193402616|gb|FK368114.1|FK368114
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
EST: gi|193563738|gb|FK517861.1|FK517861
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGG
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGG
EST: gi|193670953|gb|FK613789.1|FK613789
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCGT                         GTGGTTATTGGAGG
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGG
EST: gi|208195173|gb|GD990416.1|GD990416
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
EST: gi|208211572|gb|GE011359.1|GE011359
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
EST: gi|193694986|gb|FK634358.1|FK634358
EST:     TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCAT                         GTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
genomic: TCACAGAACGCCCAGTCAATGCAGTTACCATGTCACCTCTTCTTGATCATgtatgtatct ... ccttgtgtagGTGGTTATTGGAGGTGGTCAGGATGCCTCAGCTGTTACAACTACTGATCAT
EST: gi|208073058|gb|GD868585.1|GD868585
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 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

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                                    aattctata  TA-rich tract