1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
gtaagggtatatcaaatcaatctttcaacagtgaattattattttcttcttcatgttttgataatgttgagtaatctgtaacttgaactttttggtcactgtgattaatatgtgtagGATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTTCCACAATGTGGATTTAGTTCGCTTGCTGTAAGAGTTTTAAAACACTATG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA08G22430.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAG GATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTTEST: gi|19936158|gb|BQ080747.1|BQ080747
genomic: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAGgtaagggtat ... atatgtgtagGATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTT
EST: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAG GATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTTEST: gi|7042125|gb|AW472019.1|AW472019
genomic: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAGgtaagggtat ... atatgtgtagGATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTT
EST: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAG GATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTTEST: gi|13790877|gb|BG653468.1|BG653468
genomic: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAGgtaagggtat ... atatgtgtagGATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTT
EST: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAG GATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTTEST: gi|14992101|gb|BI317774.1|BI317774
genomic: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAGgtaagggtat ... atatgtgtagGATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTT
EST: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAG GATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTTEST: gi|15000045|gb|BI320859.1|BI320859
genomic: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAGgtaagggtat ... atatgtgtagGATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTT
EST: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAG GATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTTEST: gi|192326383|gb|FK015900.1|FK015900
genomic: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAGgtaagggtat ... atatgtgtagGATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTT
EST: TTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATAGAGCAG GATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTTEST: gi|151403203|gb|EV273013.1|EV273013
genomic: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAGgtaagggtat ... atatgtgtagGATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTT
EST: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAG GATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTTEST: gi|58023967|gb|CX710708.1|CX710708
genomic: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAGgtaagggtat ... atatgtgtagGATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTT
EST: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAG GATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTTEST: gi|58017876|gb|CX704618.1|CX704618
genomic: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAGgtaagggtat ... atatgtgtagGATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTT
EST: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAG GATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTTEST: gi|192325587|gb|FK019443.1|FK019443
genomic: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAGgtaagggtat ... atatgtgtagGATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTT
EST: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAG GATGTCAAGGATAATCCTGTTATGATTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTTEST: gi|58024154|gb|CX710895.1|CX710895
genomic: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAGgtaagggtat ... atatgtgtagGATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTT
EST: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAG GATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTTEST: gi|151412930|gb|EV282742.1|EV282742
genomic: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAGgtaagggtat ... atatgtgtagGATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTT
EST: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAG GATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTTEST: gi|10255366|gb|BE823132.1|BE823132
genomic: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAGgtaagggtat ... atatgtgtagGATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTT
EST: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAG GATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTTEST: gi|58018211|gb|CX704953.1|CX704953
genomic: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAGgtaagggtat ... atatgtgtagGATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTT
EST: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAG GATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTT
genomic: CTAATAAGCTTGAGAATTCTGGCATTTCTTTGTCAAATGTTATTGAGCAGgtaagggtat ... atatgtgtagGATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTT
aatgttgagtaatctgtaacttgaactttttggtcactgtgattaatatgtgtagGATGTCAAGGATAATCCTGTTATGGTTTACATGAAAGGTGTGCCTGATTTTCCACAATGTGGATTTAGTTCGCTTGCTGTAAGAGTTTTAAAACACTATG
gattaat putative branch site (score: 3)
tgattaatat TA-rich tract