1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
...gaattgcatttaggatctatgtctctctgcttaacttcaaaggtgttgtttcctttgtctcatgttttatttttttcacttgtatgttaatcgtgtgcagGTCCTTATCAAGGTGGTGTGTGGAAAGTAAGGGTGGATCTACCTGATGCCTATCCTTATAAGTCTCCATCTATTGGCTTTGTCAACAAAATTTTCCATCC
species | Glycine max |
transcript | GLYMA08G01940.2 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CAACGATGGCATGCAAGAGTTCTTTGTGGAATTCCACGGACCCAAAGACA GTCCTTATCAAGGTGGTGTGTGGAAAGTAAGGGTGGATCTACCTGATGCCTEST: gi|18039609|gb|BM307903.1|BM307903
genomic: CAACGATGGCATGCAAGAGTTCTTTGTGGAATTCCACGGACCCAAAGACAgtaaattttt ... tcgtgtgcagGTCCTTATCAAGGTGGTGTGTGGAAAGTAAGGGTGGATCTACCTGATGCCT
EST: CAACGATGGCATGCAAGAGTTCTTTGTGGAATTCCACGGACCCAAAGACA GTCCTTATCAAGGTGGTGTGTGGAAAGTAAGGGTGGATCTACCTGATGCCTEST: gi|193562259|gb|FK521268.1|FK521268
genomic: CAACGATGGCATGCAAGAGTTCTTTGTGGAATTCCACGGACCCAAAGACAgtaaattttt ... tcgtgtgcagGTCCTTATCAAGGTGGTGTGTGGAAAGTAAGGGTGGATCTACCTGATGCCT
EST: CAACGATGGCATGCAAGAGTTCTTTGTGGAATTCCACGGACCCAAAGACA GTCCTTATCAAGGTGGTGTGTGGAAAGTAAGGGTGGATCTACCTGATGCCTEST: gi|193681729|gb|FK620903.1|FK620903
genomic: CAACGATGGCATGCAAGAGTTCTTTGTGGAATTCCACGGACCCAAAGACAgtaaattttt ... tcgtgtgcagGTCCTTATCAAGGTGGTGTGTGGAAAGTAAGGGTGGATCTACCTGATGCCT
EST: CAACGATGGCATGCAAGAGTTCTTTGTGGAATTCCACGGACCCAAAGACA GTCCTTATCAAGGTGGTGTGTGGAAAGTAAGGGTGGATCTACCTGATGCCTEST: gi|192324802|gb|FK016873.1|FK016873
genomic: CAACGATGGCATGCAAGAGTTCTTTGTGGAATTCCACGGACCCAAAGACAgtaaattttt ... tcgtgtgcagGTCCTTATCAAGGTGGTGTGTGGAAAGTAAGGGTGGATCTACCTGATGCCT
EST: CAACGATGGCATGCAAGAGTTCTTTGTGGAATTCCACGGACCCAAAGACA GTCCTTATCAAGGTGGTGTGTGGAAAGTAAGGGTGGATCTACCTGATGCCTEST: gi|298198506|gb|HO040045.1|HO040045
genomic: CAACGATGGCATGCAAGAGTTCTTTGTGGAATTCCACGGACCCAAAGACAgtaaattttt ... tcgtgtgcagGTCCTTATCAAGGTGGTGTGTGGAAAGTAAGGGTGGATCTACCTGATGCCT
EST: CAACGATGGCATGCGAGAGTTCTTTGTGGAATTCCACGGACCCAAAGACA GTCCTTATCAAGGTGGTGTGTGGAAAGTAAGGGTGGATCTACCTGATGCCT
genomic: CAACGATGGCATGCAAGAGTTCTTTGTGGAATTCCACGGACCCAAAGACAgtaaattttt ... tcgtgtgcagGTCCTTATCAAGGTGGTGTGTGGAAAGTAAGGGTGGATCTACCTGATGCCT
ttgtttcctttgtctcatgttttatttttttcacttgtatgttaatcgtgtgcagGTCCTTATCAAGGTGGTGTGTGGAAAGTAAGGGTGGATCTACCTGATGCCTATCCTTATAAGTCTCCATCTATTGGCTTTGTCAACAAAATTTTCCATCC
tgttaat putative branch site (score: 3)
ttttatttttttcact TA-rich tract