Mapped EST sequences
Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments
ATGC EST sequence
ATGC genomic sequence (exon)
ATGC genomic sequence (truncated intron)
EST:
gi|151394114|gb|EV263985.1|EV263985EST: ATGACACTTGCCATTGGAAGCATGTTGTACCATGCTACGCTGCAACATGT GCAACAGCAAAGCGATGAAACTCCTATGGTATGGGAGGTGCTGCTGTACAT
genomic: ATGACACTTGCCATTGGAAGCATGTTGTACCATGCTACGCTGCAACATGTgtaagtatct ... tttaattcagGCAACAGCAAAGCGATGAAACTCCTATGGTATGGGAGGTGCTGCTGTACAT
EST:
gi|19269295|gb|BM885551.1|BM885551EST: ATGACACTTGCCATTGGAAGCATGTTGTACCATGCTACGCTGCAACATGT GCAACAGCAAAGCGATGAAACTCCTATGGTATGGGAGGTGCTGCTGTACAT
genomic: ATGACACTTGCCATTGGAAGCATGTTGTACCATGCTACGCTGCAACATGTgtaagtatct ... tttaattcagGCAACAGCAAAGCGATGAAACTCCTATGGTATGGGAGGTGCTGCTGTACAT
EST:
gi|192314678|gb|FK006618.1|FK006618EST: ATGACACTTGCCATTGGAAGCATGTTGTACCATGCTACGCTGCAACATGT GCAACAGCAAAGCGATGAAACTCCTATGGTATGGGAGGTGCTGCTGTACAT
genomic: ATGACACTTGCCATTGGAAGCATGTTGTACCATGCTACGCTGCAACATGTgtaagtatct ... tttaattcagGCAACAGCAAAGCGATGAAACTCCTATGGTATGGGAGGTGCTGCTGTACAT
EST:
gi|192314677|gb|FK006617.1|FK006617EST: ATGACACTTGCCATTGGAAGCATGTTGTACCATGCTACGCTGCAACATGT GCAACAGCAAAGCGATGAAACTCCTATGGTATGGGAGGTGCTGCTGTACAT
genomic: ATGACACTTGCCATTGGAAGCATGTTGTACCATGCTACGCTGCAACATGTgtaagtatct ... tttaattcagGCAACAGCAAAGCGATGAAACTCCTATGGTATGGGAGGTGCTGCTGTACAT
EST:
gi|151405041|gb|EV274855.1|EV274855EST: ATGACACTTGCCATTGGAAGCATGTTGTACCATGCTACGCTGCAACATGT GCAACAGCAAGGCGATGAAACTCCTATGGTATGGGAGGTGCTGCTGTACAT
genomic: ATGACACTTGCCATTGGAAGCATGTTGTACCATGCTACGCTGCAACATGTgtaagtatct ... tttaattcagGCAACAGCAAAGCGATGAAACTCCTATGGTATGGGAGGTGCTGCTGTACAT
EST:
gi|16348330|gb|BI973925.1|BI973925EST: ATGACACTTGCCATTGGAAGCATGTTGTACCATGCTACGCTGCAACATGT GCAACAGCAAAGCGATGAAACTCCTATGGGATGGGAGGTGCTGCTGTACAT
genomic: ATGACACTTGCCATTGGAAGCATGTTGTACCATGCTACGCTGCAACATGTgtaagtatct ... tttaattcagGCAACAGCAAAGCGATGAAACTCCTATGGTATGGGAGGTGCTGCTGTACAT
EST:
gi|27423727|gb|CA935247.1|CA935247EST: ATGACACTTGCCATTGGAAGCATGTTGTACCATGCTACGCTGCAACATGT GCAACAGCAAAGCGATGAAACTCCTATGGTATGGGAGGTGCTGCTGTACAT
genomic: ATGACACTTGCCATTGGAAGCATGTTGTACCATGCTACGCTGCAACATGTgtaagtatct ... tttaattcagGCAACAGCAAAGCGATGAAACTCCTATGGTATGGGAGGTGCTGCTGTACAT
atgc intronic sequence ATGC exonic sequenceIntronic sequence truncated to 55 bases.atgtctttctgttttggatgactatttattgttcagacgttgcactttaattcagGCAACAGCAAAGCGATGAAACTCCTATGGTATGGGAGGTGCTGCTGTACATGTACATCCTCTACTCTCCAGATTGGCATTACCGCAGTACAATGCCCATC
ctttaat putative branch site (score: 4)
tatttattgtt TA-rich tract