1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
...atgttcataaaaatacatgtagttggatggcaaaatcattgcacctacaggctctgcagcttggggatctggtaccttgcaatggcttgaattctcaaagCTTAACAAGATTACAATCAGAGGCAAAGGTGTCATTGATGGTCAAGGCTCTGTTTGGTGGAATAATGACTCTCCCACTTACAATCCCACAGAAGTGATGC
species | Glycine max |
transcript | GLYMA05G08730.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
tacaggctctgcagcttggggatctggtaccttgcaatggcttgaattctcaaagCTTAACAAGATTACAATCAGAGGCAAAGGTGTCATTGATGGTCAAGGCTCTGTTTGGTGGAATAATGACTCTCCCACTTACAATCCCACAGAAGTGATGC
ttctc CT-rich tract
ttgaatt TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| atgttcataaaaatacatgtagttggatggcaaaatcattgcacctacaggctctgcagcttggggatctggtaccttgcaatggcttgaattctcaaagCTTAACAAGATTACAATCAGAGGCAAAGGTGTCATTGATGGTCAAGGCTCTGTTTGGTGGAATAATGACTCTCCCACTTACAATCCCACAGAAGTGATGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGTGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGTGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGAAGT
- - - - aaaaata
- - - - - - - -catgtag
- - - - - - - - - - - -tggatgg
- - - - - - - - - - - - - - - caaaatc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -cacctac
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ctctgca
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ttgggga
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ccttgca
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - tggcttg