1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
gtaagtgttcaattgtgtattgctttatgtgttattgcatttcgtgccgattctgctgtttgtgagagttaatactttgctgttgtaatttgtacaacctgctatgactgtttttgaatctcagTTGGTGCCAGCTGTCACGGAGCTTGTTGTTGCAGAATTGATGTACTTGCAGTATATGGATCCTAAAGAGCCGATTTTTATTTACATAAATTCCACTGGGA
species | Glycine max |
transcript | GLYMA03G39570.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ACCTGCCTTCGCTGCTTCTCCATGGTAGAATTGTTTACATTGGCATGCCT TTGGTGCCAGCTGTCACGGAGCTTGTTGTTGCAGAATTGATGTGCTTGCAGEST: gi|209702632|gb|BW660629.1|BW660629
genomic: ACCTGCCTTCGCTGCTTCTCCATGGTAGAATTGTTTACATTGGCATGCCTgtaagtgttc ... tgaatctcagTTGGTGCCAGCTGTCACGGAGCTTGTTGTTGCAGAATTGATGTACTTGCAG
EST: ACCTGCCTTCGCTGCTTCTCCATGGTAGAATTGTTTACATTGGCATGCCT TTGGTGCCAGCTGTCACGGAGCTTGTTGTTGCAGAATTGATGTACTTGCAGEST: gi|7478792|gb|AW666408.1|AW666408
genomic: ACCTGCCTTCGCTGCTTCTCCATGGTAGAATTGTTTACATTGGCATGCCTgtaagtgttc ... tgaatctcagTTGGTGCCAGCTGTCACGGAGCTTGTTGTTGCAGAATTGATGTACTTGCAG
EST: ACCTGCCTTCGCTGCTTCTCCATGGTAGAATTGTTTACATTGGCATGCCT TTGGTGCCAGCTGTCACGGAGCTTGTTGTTGCAGAATTGATGTACTTGCAG
genomic: ACCTGCCTTCGCTGCTTCTCCATGGTAGAATTGTTTACATTGGCATGCCTgtaagtgttc ... tgaatctcagTTGGTGCCAGCTGTCACGGAGCTTGTTGTTGCAGAATTGATGTACTTGCAG
taatactttgctgttgtaatttgtacaacctgctatgactgtttttgaatctcagTTGGTGCCAGCTGTCACGGAGCTTGTTGTTGCAGAATTGATGTACTTGCAGTATATGGATCCTAAAGAGCCGATTTTTATTTACATAAATTCCACTGGGA
agttaat putative branch site (score: 4)
ctgttttt putative PPT
ttgtaattt TA-rich tract