1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
...aaaccagacacgcacttagtatgttgaacttttcacctagtaaaactcatagtaatgcttatggtttaaccaaccttaatccttattaatgtgattgcagTTTTTTCGGGCAAACAATTCCATTCACCCTTTATTCAATGGTGGAAGAACCAGTGCAACCATTGGCAATGGCACGGCTTGCTCAGGACCTAAAACTGTTG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA03G31340.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CAGATAGCCCTCCGATTTCACCTTCAGATGAATTCGACGATGTTGTTAAG TTTTTTCGGGCAAACAATTCCATTCACCCTTTATTCAATGGTGGAAGAACCEST: gi|208067271|gb|GD862237.1|GD862237
genomic: CAGATAGCCCTCCGATTTCACCTTCAGATGAATTCGACGATGTTGTTAAGgtatcatcat ... gtgattgcagTTTTTTCGGGCAAACAATTCCATTCACCCTTTATTCAATGGTGGAAGAACC
EST: CAGATAGCCCTCCGATTTCACCTTCAGATGAATTCGACGATGTTGTTAAG TTTTTTCGGGCAAACAATTCCA
genomic: CAGATAGCCCTCCGATTTCACCTTCAGATGAATTCGACGATGTTGTTAAGgtatcatcat ... gtgattgcagTTTTTTCGGGCAAACAATTCCA
ctcatagtaatgcttatggtttaaccaaccttaatccttattaatgtgattgcagTTTTTTCGGGCAAACAATTCCATTCACCCTTTATTCAATGGTGGAAGAACCAGTGCAACCATTGGCAATGGCACGGCTTGCTCAGGACCTAAAACTGTTG
tattaat putative branch site (score: 2)
ttaatccttattaat TA-rich tract