1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtattttcccttttctttttttttgttttctattctgttttaattttttttaatgtggagtagcaacttcggcaaggtaatattcttaataaattatcagGTAAAGCTGCATGGGGTTTCTGTGTTTCTCATGCCATCTGGGATGCTGGGAACGCTCCTTTCTCTAGTTGATGTTTTGCCTCTATTCTCTAACACTGCAT
species | Glycine max |
transcript | GLYMA01G04400.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AACATACTTTGCAGTTTGATTCATGGGAAGAGCCTGCAGAGTTGGAATAT GTAAAGCTGCATGGGGTTTCTGTGTTTCTCATGCCATCTGGGATGCTGGGAEST: gi|209716453|gb|BW676929.1|BW676929
genomic: AACATACTTTGCAGTTTGATTCATGGGAAGAGCCTGCAGAGTTGGAATATgtattttccc ... aaattatcagGTAAAGCTGCATGGGGTTTCTGTGTTTCTCATGCCATCTGGGATGCTGGGA
EST: AACATACTTTGCAGTTTGATTCATGGGAAGAGCCTGCAGAGTTGGAATAT GTAAAGCTGCATGGGGTTTCTGTGTTTCTCATGCCATCTGGGATGCTGGGAEST: gi|6482414|gb|AW201675.1|AW201675
genomic: AACATACTTTGCAGTTTGATTCATGGGAAGAGCCTGCAGAGTTGGAATATgtattttccc ... aaattatcagGTAAAGCTGCATGGGGTTTCTGTGTTTCTCATGCCATCTGGGATGCTGGGA
EST: AACATACTNTGCAGTTTGATTCATGGGAAGAGCCTGCAGAGTTGGAATAT GTAAAGCTGCATG
genomic: AACATACTTTGCAGTTTGATTCATGGGAAGAGCCTGCAGAGTTGGAATATgtattttccc ... aaattatcagGTAAAGCTGCATG
ttttttaatgtggagtagcaacttcggcaaggtaatattcttaataaattatcagGTAAAGCTGCATGGGGTTTCTGTGTTTCTCATGCCATCTGGGATGCTGGGAACGCTCCTTTCTCTAGTTGATGTTTTGCCTCTATTCTCTAACACTGCAT
tcttaat putative branch site (score: 3)
aaggtaatattcttaa TA-rich tract