Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   		20  
 5'  3'   
21  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtactaataatatcaattttactattttaattctgaatattaattgttctaggttttttgatgattggtttcaattatattatatcttagtttataattttcatgtgtccttttatgtgcagAGATTTACTGGTTTCCTTCAGAAAGGCAACAGGACAAAAGCCACTACGAATTATATTTTACAG

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA10G38770.1
intron # 16
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|19937592|gb|BQ081352.1|BQ081352
EST:     AAAACTTGGCAAGACCCTGTTCGTGGCACAGTTAGTGGTGGCATGATCCG                         AGATTTACTGGTTTCCTTCAGAAAGGCAACAGGACAAAAGCCACTACGAAT
genomic: AAAACTTGGCAAGACCCTGTTCGTGGCACAGTTAGTGGTGGCATGATCCGgtactaataa ... ttatgtgcagAGATTTACTGGTTTCCTTCAGAAAGGCAACAGGACAAAAGCCACTACGAAT






















 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

gtttcaattatattatatcttagtttataattttcatgtgtccttttatgtgcagAGATTTACTGGTTTCCTTCAGAAAGGCAACAGGACAAAAGCCACTACGAATTATATTTTACAG
                                      tgtcctttt  CT-rich tract
     aattatattatatctt  TA-rich tract