1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' |
gtaaaattatatcatcgcattcactacactgagtttatttatgaagtgcacaagtatgtgtaatttcagtgggttaaaatcatgttgtatcttaaattaaatcaagggtgaatacaagtcttgtgcattttaaagacaaacagtctttggctattattattgatttaactattttgttgtcatgcagTGTGTCATTGCTACTGACAACAACCGAGGCAGCTGTGGTGGATAATTCACATGACAAGAATAAACCTCCTAGTCGGGTGCCAGATATGGATGATTTGGAT
species | Glycine max |
transcript | GLYMA07G01190.1 |
intron # | 16 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATAATAGATCCTCTCAAAGTTGTTAGAACTGCTTTGGTAGATGCTGCCAG TGTGTCATTGCTACTGACAACAACCGAGGCAGCTGTGGTGGATAATTCACAEST: gi|18040485|gb|BM308779.1|BM308779
genomic: ATAATAGATCCTCTCAAAGTTGTTAGAACTGCTTTGGTAGATGCTGCCAGgtaaaattat ... tgtcatgcagTGTGTCATTGCTACTGACAACAACCGAGGCAGCTGTGGTGGATAATTCACA
EST: ATAATAGATCCTCTCAAAGTTGTTAGAACTGCTTTGGTAGATGCTGCCAG TGTGTCATTGCTACTGACAACAACCGAGGCAGCTGTGGTGGATAATTCACAEST: gi|22525526|gb|BU084337.1|BU084337
genomic: ATAATAGATCCTCTCAAAGTTGTTAGAACTGCTTTGGTAGATGCTGCCAGgtaaaattat ... tgtcatgcagTGTGTCATTGCTACTGACAACAACCGAGGCAGCTGTGGTGGATAATTCACA
EST: ATAATAGATCCTCTCAAAGTTGTTAGAACTGCTTTGGTAGATGCTGCCAG TGTGTCATTGCTACTGACAACAACCGAGGCAGCTGTGGTGGATAATTCACAEST: gi|18714477|gb|BM522781.1|BM522781
genomic: ATAATAGATCCTCTCAAAGTTGTTAGAACTGCTTTGGTAGATGCTGCCAGgtaaaattat ... tgtcatgcagTGTGTCATTGCTACTGACAACAACCGAGGCAGCTGTGGTGGATAATTCACA
EST: TCTCAAAGTTGTTAGAACTGCTTTGGTAGATGCTGCCAG TGTGTCATTGCTACTGACAACAACCGAGGCAGCTGTGGTGGATAATTCACAEST: gi|298171846|gb|HO021438.1|HO021438
genomic: TCTCAAAGTTGTTAGAACTGCTTTGGTAGATGCTGCCAGgtaaaattat ... tgtcatgcagTGTGTCATTGCTACTGACAACAACCGAGGCAGCTGTGGTGGATAATTCACA
EST: ATAATAGATCCTCTCAAAGTTGTTAGAACTGCTTTGGTAGATGCTGCCAG TGTGTCATTGCTACTGACAACAACCGAGGCAGCTGTGGTGGATAATTCACA
genomic: ATAATAGATCCTCTCAAAGTTGTTAGAACTGCTTTGGTAGATGCTGCCAGgtaaaattat ... tgtcatgcagTGTGTCATTGCTACTGACAACAACCGAGGCAGCTGTGGTGGATAATTCACA
aagacaaacagtctttggctattattattgatttaactattttgttgtcatgcagTGTGTCATTGCTACTGACAACAACCGAGGCAGCTGTGGTGGATAATTCACATGACAAGAATAAACCTCCTAGTCGGGTGCCAGATATGGATGATTTGGAT
atttaac putative branch site (score: 3)
ttttgtt putative PPT
tattattattgattta TA-rich tract