Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   		20  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtaactgtgcttaccttttttttataacaccaatcctctttgctgtagacttgaatatttttctgttgtaagctattaacagGGTGGTCTGGATGATGGTGGTGCTGCTACTGTAAGAGCCTTAACACACTGGCAGTATCGAACAATTTCTAGAGAAAATCACTCCATATTAGACAATCTTG

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA20G38200.1
intron # 15
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|192302938|gb|FG996954.1|FG996954
EST:     AGAAAGATTTTAGAGTTATAATTGTGATGCCCCTCTTGCCTGGTTTCCAG                         GGTGGTCTGGATGATGGTGGTGCTGCTACTGTAAGAGCCTTAACACACTGG
genomic: AGAAAGATTTTAGAGTTATAATTGTGATGCCCCTCTTGCCTGGTTTCCAGgtaactgtgc ... ctattaacagGGTGGTCTGGATGATGGTGGTGCTGCTACTGTAAGAGCCTTAACACACTGG






















 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

caccaatcctctttgctgtagacttgaatatttttctgttgtaagctattaacagGGTGGTCTGGATGATGGTGGTGCTGCTACTGTAAGAGCCTTAACACACTGGCAGTATCGAACAATTTCTAGAGAAAATCACTCCATATTAGACAATCTTG
                     acttgaatattttt  TA-rich tract