1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' |
gtattgaaaaaatatttttgatcacttgcaacctgtgctatttattcatgcggccttcacgcaattttgtacttgaatgttaaagtggctttcctctacttttcctttttacctcttaaaagggggcttacaaaatgcaaagtttgtaagtgattacatttacatgtctgggtgcagCTTTCATCAAGTGCAGCTAATGCTTCATCTAATGGGAACGGTCCTTCAGAATTAGCGGATGATGACTTGCCAAGTGTGATGACGTGTGCAAATTACCTTA
species | Glycine max |
transcript | GLYMA11G11490.1 |
intron # | 15 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTCCTGGTGGACTNGCAGTTCTAAATCCAAAATTAACGATTGTGAGGAAG CTTTCATCAAGTGCAGCTAATGCTTCATCTAATGGGAACGGTCCTTCAGAAEST: gi|17400311|gb|BM177093.1|BM177093
genomic: CTCCTGGTGGACTGGCAGTTCTAAATCCAAAATTAACGATTGTGAGGAAGgtattgaaaa ... ctgggtgcagCTTTCATCAAGTGCAGCTAATGCTTCATCTAATGGGAACGGTCCTTCAGAA
EST: CTCCTGGTGGACTGGCAGTTCTAAATCCAAAATTAACGATTGTGAGGAAG CTTTCATCAAGTGCAGCTAATGCTTCATCTAATGGGAACGGTCCTTCAGAAEST: gi|7028762|gb|AW458545.1|AW458545
genomic: CTCCTGGTGGACTGGCAGTTCTAAATCCAAAATTAACGATTGTGAGGAAGgtattgaaaa ... ctgggtgcagCTTTCATCAAGTGCAGCTAATGCTTCATCTAATGGGAACGGTCCTTCAGAA
EST: CTCCTGGTGGACTGGCAGTTCTAAATCCAAAATTAACGATTGTGAGGAAG CTTTCATCAAGTGCAGCTAATGCTTCATCTAATGGGAACGGTCCTTCAGAAEST: gi|11275017|gb|BF325341.1|BF325341
genomic: CTCCTGGTGGACTGGCAGTTCTAAATCCAAAATTAACGATTGTGAGGAAGgtattgaaaa ... ctgggtgcagCTTTCATCAAGTGCAGCTAATGCTTCATCTAATGGGAACGGTCCTTCAGAA
EST: CTCCTGGTGGACTGGCAGTTCTAAATCCATAATTAACGATTGTGAGGAAG CTTTCATCAAGTGCAGCTAATGCTTCATCTAATGGGAACGGTCCTTCAGAAEST: gi|15814707|gb|BI786982.1|BI786982
genomic: CTCCTGGTGGACTGGCAGTTCTAAATCCAAAATTAACGATTGTGAGGAAGgtattgaaaa ... ctgggtgcagCTTTCATCAAGTGCAGCTAATGCTTCATCTAATGGGAACGGTCCTTCAGAA
EST: CTCCTGGTGGACTGGCAGTTCTAAATCCAAAATTAACGATTGTGAGGAAG CTTTCATCAAGTGCAGCTAATGCTTCATCTAATGGGAACGGTCCTTCAGAAEST: gi|23732846|gb|BU764597.1|BU764597
genomic: CTCCTGGTGGACTGGCAGTTCTAAATCCAAAATTAACGATTGTGAGGAAGgtattgaaaa ... ctgggtgcagCTTTCATCAAGTGCAGCTAATGCTTCATCTAATGGGAACGGTCCTTCAGAA
EST: CTCCTGGTGGACTGGCAGTTCTAAATCCAAAATTAACGATTGTGAGGAAG CTTTCATCAAGTGCAGCTAATGCTTCATCTAATGGGAACGGTCCTTCAGAAEST: gi|11274082|gb|BF324450.1|BF324450
genomic: CTCCTGGTGGACTGGCAGTTCTAAATCCAAAATTAACGATTGTGAGGAAGgtattgaaaa ... ctgggtgcagCTTTCATCAAGTGCAGCTAATGCTTCATCTAATGGGAACGGTCCTTCAGAA
EST: CGATTGTGAGGAAG CTTTCATCAAGTGCAGCTAATGCTTCATCTAATGGGAACGGTCCTTCAGAAEST: gi|208175474|gb|GD976869.1|GD976869
genomic: CGATTGTGAGGAAGgtattgaaaa ... ctgggtgcagCTTTCATCAAGTGCAGCTAATGCTTCATCTAATGGGAACGGTCCTTCAGAA
EST: CTCCTGGTGGACTGGCAGTTCTAAATCCAAAATTAACGATTGTGAGGAAG CTTTCATCAAGTGCAGCTAATGCTTCATEST: gi|10843371|gb|BF066672.1|BF066672
genomic: CTCCTGGTGGACTGGCAGTTCTAAATCCAAAATTAACGATTGTGAGGAAGgtattgaaaa ... ctgggtgcagCTTTCATCAAGTGCAGCTAATGCTTCAT
EST: CTCCTGGTGGACTGGCAGTTCTAAATCCAAAATTAACGATTGTGAGGAAG CTTTCATCAAGTGCAGCTAATGCTTCATCTAATGGGAACGGTCCTTCAGAA
genomic: CTCCTGGTGGACTGGCAGTTCTAAATCCAAAATTAACGATTGTGAGGAAGgtattgaaaa ... ctgggtgcagCTTTCATCAAGTGCAGCTAATGCTTCATCTAATGGGAACGGTCCTTCAGAA
ggggcttacaaaatgcaaagtttgtaagtgattacatttacatgtctgggtgcagCTTTCATCAAGTGCAGCTAATGCTTCATCTAATGGGAACGGTCCTTCAGAATTAGCGGATGATGACTTGCCAAGTGTGATGACGTGTGCAAATTACCTTA
ggcttac putative branch site (score: 3)
attacattta TA-rich tract