Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gttggattaactgcaattttccaataaattttattctacgaactagttggtgtccctttgaattgtcacaaattgcttatccttttatttgtttttcttacagTGATGTCGTTCACATGGTCAGTTATGCGCCACTCTTTGTAAACACAAATGATAGAAA

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA19G30150.1
intron # 14
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GLYMA19G30150.1 (Glycine max), 3'ss of exon 14
lower sequence: AT3G10740.1 (Arabidopsis thaliana), 3'ss of exon 14
gttggattaactgcaattttccaataaattttattctacgaactagttggtgtccctttgaattgtcacaaattgcttatccttttatttgtttttcttacagTGATGTCGTTCACATGGTCAGTTATGCGCCACTCTTTGTAAACACAAATGATAGAAA
                 || ||  | |||||   |   |   ||  ||| | ||   |  ||   |||  |||   |||  | | |  |   |||  || ||||||  | ||| | ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  
----------------gttccctttgaatttctcttcccaggct--ttgatctcaactaaaaacatca--aataagttaaacatcttatgacttt--ttgcagTGACATTGTTGAAATGGCAAGTTATGCTCCACTCTTTGTGAACACAAATGATAGACG


















 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

ggtgtccctttgaattgtcacaaattgcttatccttttatttgtttttcttacagTGATGTCGTTCACATGGTCAGTTATGCGCCACTCTTTGTAAACACAAATGATAGAAA
                        ttgcttatccttttat  CT-rich tract
                                  ttttatttgtttttct  TA-rich tract