1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' |
gtgagcctatcgtacatgatgtaaagtaatcatgtccatcactttaatgtttacccttcattattatctttcttttctgtatggcttcttacattcatttgtaatttttgcaagtttagTTTGCGGGTTCGATCGGAGCAGTCACTTGTGAGGTGGGCTACACCCCAACTCCATGATATAGATGCCTTGGCCAAAATGGTTGATCCTACTTTGAACGGC
species | Glycine max |
transcript | GLYMA15G11820.1 |
intron # | 14 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTTGGGGTGGTTATGCTGGAACTATTGACTGGTCGGAAGCCACTTGACAG TTTGCGGGTTCGATCGGAGCAGTCACTTGTGAGGTGGGCTACACCCCAACTEST: gi|193365287|gb|FK329736.1|FK329736
genomic: TTTGGGGTGGTTATGCTGGAACTATTGACTGGTCGGAAGCCACTTGACAGgtgagcctat ... gcaagtttagTTTGCGGGTTCGATCGGAGCAGTCACTTGTGAGGTGGGCTACACCCCAACT
EST: TTTGGGGTGGTTATGCTGGAACTATTGACTGGTCGGAAGCCACTTGACAG TTTGCGGGTTCGATCGGAGCAGTCACTTGTGAGGTGGGCTACACCCCAACTEST: gi|208179752|gb|GD978417.1|GD978417
genomic: TTTGGGGTGGTTATGCTGGAACTATTGACTGGTCGGAAGCCACTTGACAGgtgagcctat ... gcaagtttagTTTGCGGGTTCGATCGGAGCAGTCACTTGTGAGGTGGGCTACACCCCAACT
EST: TTTGGGGTGGTTATGCTGGAACTATTGACTGGTCGGAAGCCACTTGACAG TTTGCGGGTTCGATCGGAGCAGTCACTTGTGAGGTGGGCTACACCCCAACTEST: gi|7686127|gb|AW756775.1|AW756775
genomic: TTTGGGGTGGTTATGCTGGAACTATTGACTGGTCGGAAGCCACTTGACAGgtgagcctat ... gcaagtttagTTTGCGGGTTCGATCGGAGCAGTCACTTGTGAGGTGGGCTACACCCCAACT
EST: TTTGGGGTGGTTATGCTGGAACTATTGACTGGTCGGAAGCCACTTGACAG TTTGCGGGTTCGATCGGAGCAGTCACTTGTGAGGTGGGCTACACCCCAACTEST: gi|51343865|gb|CO984598.1|CO984598
genomic: TTTGGGGTGGTTATGCTGGAACTATTGACTGGTCGGAAGCCACTTGACAGgtgagcctat ... gcaagtttagTTTGCGGGTTCGATCGGAGCAGTCACTTGTGAGGTGGGCTACACCCCAACT
EST: TTTGGGGTGGTTATGCTGGAACTATTGACTGGTCGGAAGCCACTTGACAG TTTGCGGGTTCGATCGGAGCAGTCACTTGTGAGGTGGGCTACACCCCAACTEST: gi|4396176|gb|AI495173.1|AI495173
genomic: TTTGGGGTGGTTATGCTGGAACTATTGACTGGTCGGAAGCCACTTGACAGgtgagcctat ... gcaagtttagTTTGCGGGTTCGATCGGAGCAGTCACTTGTGAGGTGGGCTACACCCCAACT
EST: TTTGGGGTGGTTATGCTGGAACTATTGACTGGTCGGAAGCCACTTGACAG TTTGCGGGTTCGATCGGAGCAGTCACTTGTGAGGTGGGCTACACCCCAACT
genomic: TTTGGGGTGGTTATGCTGGAACTATTGACTGGTCGGAAGCCACTTGACAGgtgagcctat ... gcaagtttagTTTGCGGGTTCGATCGGAGCAGTCACTTGTGAGGTGGGCTACACCCCAACT
tatctttcttttctgtatggcttcttacattcatttgtaatttttgcaagtttagTTTGCGGGTTCGATCGGAGCAGTCACTTGTGAGGTGGGCTACACCCCAACTCCATGATATAGATGCCTTGGCCAAAATGGTTGATCCTACTTTGAACGGC
ttcttac putative branch site (score: 2)
tttttgc putative PPT
ttacattcatttgtaa TA-rich tract