Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   		18  
 5'  3'   		19  
 5'  3'   		20  
 5'  3'   
21  
 5'  3'   		22  
 5'  3'   		23  
 5'  3'   		24  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtatgtacctatgactacctgttctagctttaaaaacaatattggcatgctctttacaagttttatgctttcttctgtttgtagtttagagttactaatactgatactttcttttgtagCTGCTGAATTATATGATTTTGATGATGAGAAG

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA13G28720.1
intron # 14
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|254331883|gb|GR846193.1|GR846193
EST:     CAAAATGAAGAAATTTACTGAAGATGCCATCAAATTTAAGATGGATGACA                         CTGCTGAATTATATGATTTTGATGATGAGAAG
genomic: CAAAATGAAGAAATTTACTGAAGATGCCATCAAATTTAAGATGGATGACAgtatgtacct ... tcttttgtagCTGCTGAATTATATGATTTTGATGATGAGAAG






















 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

atgctttcttctgtttgtagtttagagttactaatactgatactttcttttgtagCTGCTGAATTATATGATTTTGATGATGAGAAG
                                        tactttctttt  CT-rich tract
                           ttactaata  TA-rich tract