Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   		17  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtaagacacgctagcatattgttcaaattgaatggaaaaaaaaaacaactcatttgtgattagcttggttcttctgaatgactacaaatttctatgatgcaagGATCACGAAGCTCAAACCTCTTGAGGCACTTGCAAAAGGGATTCTTGCCAGCAATATGCTCATTACCTATTCCGGGTTATATG

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA12G09390.1
intron # 14
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|18730596|gb|BM525966.1|BM525966
EST:     TTCCTATGAAGACATTATAAAACTACCAAATAAGGTTCTTCTATGGTGTG                         GATCACGAAGCTCAAACCTCTTGAGGCACTTGCAAAAGGGATTCTTGCCAG
genomic: TTCCTATGAAGACATTATAAAACTACCAAATAAGGTTCTTCTATGGTGTGgtaagacacg ... atgatgcaagGATCACGAAGCTCAAACCTCTTGAGGCACTTGCAAAAGGGATTCTTGCCAG






















 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

ctcatttgtgattagcttggttcttctgaatgactacaaatttctatgatgcaagGATCACGAAGCTCAAACCTCTTGAGGCACTTGCAAAAGGGATTCTTGCCAGCAATATGCTCATTACCTATTCCGGGTTATATG
                                        tttctat  CT-rich tract
                                     aaatttctat  TA-rich tract