1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' |
gttggtcaactgtcaattcctatatcgcagttttgttttcttatattcctgtctctgctctacctgtttcagacgtaaaatatctttctattgacttgcagAATTGAAGAATTTAATTCTCTATTTAATCAGCATATGCATGCCAACCGCCTGGACCAAATAACTGTTGTAAACTTAGTGAATGTTATCAACAGAGGGGAA
species | Glycine max |
transcript | GLYMA05G25980.1 |
intron # | 14 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GTAGATGATAACTCAGCAGCTCAAGCTGCTGTTGGACTCACCCCTGAAAG AATTGAAGAATTTAATTCTCTATTTAATCAGCATATGCATGCCAACCGCCTEST: gi|208059101|gb|GD856151.1|GD856151
genomic: GTAGATGATAACTCAGCAGCTCAAGCTGCTGTTGGACTCACCCCTGAAAGgttggtcaac ... tgacttgcagAATTGAAGAATTTAATTCTCTATTTAATCAGCATATGCATGCCAACCGCCT
EST: GTAGATGATAACTCAGCAGCTCAAGCTGCTGTTGGACTCACCCCTGAAAG AATTGAAGAATTTAATTCTCTAEST: gi|207828744|gb|GD800869.1|GD800869
genomic: GTAGATGATAACTCAGCAGCTCAAGCTGCTGTTGGACTCACCCCTGAAAGgttggtcaac ... tgacttgcagAATTGAAGAATTTAATTCTCTA
EST: GTAGATGATAACTCAGCAGCTCAAGCTGCTGTTGGACTCACCCCTGAAAG AATTGAAGAATTTAATTCTCTATTTAATCAEST: gi|208236812|gb|GE029290.1|GE029290
genomic: GTAGATGATAACTCAGCAGCTCAAGCTGCTGTTGGACTCACCCCTGAAAGgttggtcaac ... tgacttgcagAATTGAAGAATTTAATTCTCTATTTAATCA
EST: GTAGATGATAACTCAGCAGCTCAAGCTGCTGTTGGACTCACCCCTGAAAG AATTGAAGAATTTAATTCTCTATTTAATCAGCATATGCATGCCAACCGCCT
genomic: GTAGATGATAACTCAGCAGCTCAAGCTGCTGTTGGACTCACCCCTGAAAGgttggtcaac ... tgacttgcagAATTGAAGAATTTAATTCTCTATTTAATCAGCATATGCATGCCAACCGCCT
tcctgtctctgctctacctgtttcagacgtaaaatatctttctattgacttgcagAATTGAAGAATTTAATTCTCTATTTAATCAGCATATGCATGCCAACCGCCTGGACCAAATAACTGTTGTAAACTTAGTGAATGTTATCAACAGAGGGGAA
tattgac putative branch site (score: 2)
tctttctatt CT-rich tract
taaaatatctttctat TA-rich tract