Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   		16  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtaagtgttacattgatggacaatacaatgcacataaattcactaattgatgaaatatatttgctactaatgtctaacgttaatggattggttatttttgtcatcaatttgtagCGACTAAATCCCACGGAATTTTATGCTGACTTAATAATTGAGAATGACTATGTTGAATGCACAGGATCGGCAATTCAAAGTTTAGTGTTTTTCAAAAGTC

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA15G10870.1
intron # 13
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|51338033|gb|CO981899.1|CO981899
EST:     ATGGAGGTATANNNGCGTGGGAGCCAACAATATCTCAAAAATGGTTGGAA                         CGACTAAATCCCACGGAATTTTATGCTGACTTAATAATTGGGATTGACTAT
genomic: ATGGAGGTATACCTGCGTGGGAGCCAGTAAGATCTCAAAAATGGTTGGAAgtaagtgtta ... caatttgtagCGACTAAATCCCACGGAATTTTATGCTGACTTAATAATTGAGAATGACTAT






















 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tttgctactaatgtctaacgttaatggattggttatttttgtcatcaatttgtagCGACTAAATCCCACGGAATTTTATGCTGACTTAATAATTGAGAATGACTATGTTGAATGCACAGGATCGGCAATTCAAAGTTTAGTGTTTTTCAAAAGTC
                                ttatttttgt  TA-rich tract