1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' |
gttaatcccctgaagtatttattcttcatgtattgtgtctttgggatggcgataattggcttgagtttagatgatcacatgttttgcttttgcatattttgactggttatgtttaaactgtcttcttacttgtatttggattgatccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAAGTGGATCAACAAAAAATGGAGAGAAGGATTTTATGTCACTGCTATGGC
species | Glycine max |
transcript | GLYMA06G09190.1 |
intron # | 13 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|208195596|gb|GD989929.1|GD989929
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTACAGCEST: gi|193532847|gb|FK493269.1|FK493269
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGC
EST: GCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|208322512|gb|GE121741.1|GE121741
genomic: GCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|207745915|gb|GD718719.1|GD718719
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|15337521|gb|BI498177.1|BI498177
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: TGCCATAGCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|193323301|gb|FK292533.1|FK292533
genomic: TGCCATAGCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|193493200|gb|FK463030.1|FK463030
genomic: GCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATTGGTATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|193349477|gb|FK318595.1|FK318595
genomic: GCCGGGGCTAATAA-TGG-ATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|193401851|gb|FK369310.1|FK369310
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|193320898|gb|FK287679.1|FK287679
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|207687344|gb|GD669346.1|GD669346
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: CCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|207790752|gb|GD761889.1|GD761889
genomic: CCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|208125259|gb|GD921031.1|GD921031
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|208149484|gb|GD948930.1|GD948930
genomic: GCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|208277948|gb|GE075347.1|GE075347
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|207728834|gb|GD708256.1|GD708256
genomic: GCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|193390169|gb|FK356873.1|FK356873
genomic: GGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCTAGTCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTEST: gi|193377059|gb|FK342696.1|FK342696
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGC-AG-CAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATT
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|208044757|gb|GD841909.1|GD841909
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|51343674|gb|CO984407.1|CO984407
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: TGCCATAGCNNNGNCTAATAATGGATNNNCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|208152046|gb|GD950019.1|GD950019
genomic: TGCCATAGCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|193442804|gb|FK408788.1|FK408788
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|193445039|gb|FK405367.1|FK405367
genomic: GGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|193426281|gb|FK389056.1|FK389056
genomic: GCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAGAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|208091185|gb|GD890938.1|GD890938
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGG-TTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|193728992|gb|FK665646.1|FK665646
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|193717757|gb|FK652959.1|FK652959
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|208222336|gb|GE020774.1|GE020774
genomic: GCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|207837070|gb|GD808379.1|GD808379
genomic: GCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|193527137|gb|FK484593.1|FK484593
genomic: GCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|193526486|gb|FK483788.1|FK483788
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACCTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|207702142|gb|GD682015.1|GD682015
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|193647519|gb|FK589652.1|FK589652
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|207790564|gb|GD760917.1|GD760917
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|207845921|gb|GD820250.1|GD820250
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|208120226|gb|GD919321.1|GD919321
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|193406327|gb|FK373522.1|FK373522
genomic: GCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|193359213|gb|FK326272.1|FK326272
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|193308436|gb|FK277371.1|FK277371
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|208177741|gb|GD974866.1|GD974866
genomic: GCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAGTAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|193365817|gb|FK333262.1|FK333262
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTEST: gi|193376185|gb|FK342564.1|FK342564
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTAT-AAAGTCAGTGATTCATTTCCATTT
EST: GCTAATAATGGATCCCCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|193515753|gb|FK473343.1|FK473343
genomic: GCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|208060662|gb|GD856640.1|GD856640
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGACTAATAATGGATCCTCATTGGCTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTTEST: gi|193589444|gb|FK544160.1|FK544160
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCA-TTT
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|208168174|gb|GD966498.1|GD966498
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGCCAGTGATTCATTTCCATTTAEST: gi|193462719|gb|FK428184.1|FK428184
genomic: GCCGGGGCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
EST: GCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAG GTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
genomic: GCTAATAATGGATCCTCATTGGTTGTAATGTCTAAAGgttaatcccc ... atccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTA
ttgactggttatgtttaaactgtcttcttacttgtatttggattgatccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAAGTGGATCAACAAAAAATGGAGAGAAGGATTTTATGTCACTGCTATGGC
tcctttt CT-rich tract
ttatgtttaaa TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| gttaatcccctgaagtatttattcttcatgtattgtgtctttgggatggcgataattggcttgagtttagatgatcacatgttttgcttttgcatattttgactggttatgtttaaactgtcttcttacttgtatttggattgatccttttagGTACCCAGTACTTGCAGCAATCCTATAAAGTCAGTGATTCATTTCCATTTAAGTGGATCAACAAAAAATGGAGAGAAGGATTTTATGTCACTGCTATGGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGTGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGA