1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' |
...tgtaaccaaaacacaatgatagtggccattttagcacatacaagagtgaatgacaccagatttatctctttaatttcctgtttgttgttcattcatgcagAACTTTCTGGTGTACCCCCTGATGTCATCAATCGGCTTATACCAGAGCATGCGCGTAAACAGAACTTATTTATGGCTTTGCACACCTAGCAATGCCCCCC
species | Glycine max |
transcript | GLYMA12G28730.1 |
intron # | 12 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CCTTCCTAATGGTCGACCACTTCCTCCACTGTTTAATTTTAAACCTCAGG AACTTTCTGGTGTACCTCCTGATGTCATCAATCGGCTTATTCCAGAGCATGEST: gi|6719212|gb|AW306859.1|AW306859
genomic: CCTTCCTAATGCTCGACCACTTCCTCCACTGTTTAATTTTAAACCTCAGGgtgagtttaa ... attcatgcagAACTTTCTGGTGTACCCCCTGATGTCATCAATCGGCTTATACCAGAGCATG
EST: CCTTCCTAATGCTCGACCACTTCCTCCACTGTTTAATTNTAAACCTCAGG AACTTTCTGGTGTACCCCCTGATGTCATCAATCGGCTTATACCAGAGCATGEST: gi|151408852|gb|EV278660.1|EV278660
genomic: CCTTCCTAATGCTCGACCACTTCCTCCACTGTTTAATTTTAAACCTCAGGgtgagtttaa ... attcatgcagAACTTTCTGGTGTACCCCCTGATGTCATCAATCGGCTTATACCAGAGCATG
EST: CCTTCCTAATGCTCGACCACTTCCTCCACTGTTTAATTTTAAACCTCAGG AACTTTCTGGTGTACCCCCTGATGTCATCAATCGGCTTATACCAGAGCATGEST: gi|9903227|gb|BE612195.1|BE612195
genomic: CCTTCCTAATGCTCGACCACTTCCTCCACTGTTTAATTTTAAACCTCAGGgtgagtttaa ... attcatgcagAACTTTCTGGTGTACCCCCTGATGTCATCAATCGGCTTATACCAGAGCATG
EST: CCTTCCTAATGCTCGACCACTTCCTCCACTGTTTAATTCTAAACCTCAGG AACTTTCTGGTGTACCCTCTGATGTCATCAATCGGCTTATACCAGAGCATGEST: gi|13479623|gb|BG508966.1|BG508966
genomic: CCTTCCTAATGCTCGACCACTTCCTCCACTGTTTAATTTTAAACCTCAGGgtgagtttaa ... attcatgcagAACTTTCTGGTGTACCCCCTGATGTCATCAATCGGCTTATACCAGAGCATG
EST: CCTTCCTAATGGTCGACCACTTCCTCCACTGTTTAATTTTAAACCTCAGG AACTTTCTGGTGTACCCCCTGATGTCATCAATCGGCTTATTCCAGAGCATGEST: gi|7589778|gb|AW705545.1|AW705545
genomic: CCTTCCTAATGCTCGACCACTTCCTCCACTGTTTAATTTTAAACCTCAGGgtgagtttaa ... attcatgcagAACTTTCTGGTGTACCCCCTGATGTCATCAATCGGCTTATACCAGAGCATG
EST: CCTTCCTAATGGTCGACCACTTCCTCCACTGTTTAATTTTAAACCTGAGG AACTTTCTGGTGTACCCCCTGATGTCATCAATCGGCTTATTCCAGAGCATG
genomic: CCTTCCTAATGCTCGACCACTTCCTCCACTGTTTAATTTTAAACCTCAGGgtgagtttaa ... attcatgcagAACTTTCTGGTGTACCCCCTGATGTCATCAATCGGCTTATACCAGAGCATG
gtgaatgacaccagatttatctctttaatttcctgtttgttgttcattcatgcagAACTTTCTGGTGTACCCCCTGATGTCATCAATCGGCTTATACCAGAGCATGCGCGTAAACAGAACTTATTTATGGCTTTGCACACCTAGCAATGCCCCCC
ctttaat putative branch site (score: 4)
ttcattc putative PPT
atttatctctttaatt TA-rich tract