1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' | 18 5' 3' | 19 5' 3' |
gttattctctaacttttggaatatttttaattatatatcaattgagaggaaagattatcttgggctgcggagtaaaaaatatcttctagctatatttcgtgcacctttaatttttatattattattattatttggattatctttgtagGGAACAGCTTTGACAGTCACAACAATTGGATTTCTTAAGGAAGCTCCTCAAGTCAATATCCATGGTTTCAATGTATATCACAAAAATCGGCTTATACTG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA04G35870.1 |
intron # | 12 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AGTTCCCTCAATTTGTTAAATATGCACCAGTAATTGGTGGATCCGTAAAG GGAACAGCTTTGACAGTCACAACAATTGGATTTCTTAAGGAAGCTCCTCAAEST: gi|21256821|gb|BQ453709.1|BQ453709
genomic: AGTTCCCTCAATTTGTTAAATATGCACCAGTAATTGGTGGATCCGTAAAGgttattctct ... atctttgtagGGAACAGCTTTGACAGTCACAACAATTGGATTTCTTAAGGAAGCTCCTCAA
EST: ATTGGTGGATCCGTAAAG GGAACAGCTTTGACAGTCACAACAATTGGATTTCTTAAGGAAGCTCCTCAAEST: gi|9203797|gb|BE330021.1|BE330021
genomic: ATTGGTGGATCCGTAAAGgttattctct ... atctttgtagGGAACAGCTTTGACAGTCACAACAATTGGATTTCTTAAGGAAGCTCCTCAA
EST: GGATCCGTAAAG GGAACAGCTTTGACAGTCACAACAATTGGATTTCTTAAGGAAGCTCCTCAAEST: gi|208096014|gb|GD892450.1|GD892450
genomic: GGATCCGTAAAGgttattctct ... atctttgtagGGAACAGCTTTGACAGTCACAACAATTGGATTTCTTAAGGAAGCTCCTCAA
EST: AGTTCCCTCAATTTGTTAAATATGCACCAGTAATTGGTGGATCCGTAAAG GGAACAGCTTTGACAGTCACAACAATTGGATTTCTTAAGGAAGCTCCTCAA
genomic: AGTTCCCTCAATTTGTTAAATATGCACCAGTAATTGGTGGATCCGTAAAGgttattctct ... atctttgtagGGAACAGCTTTGACAGTCACAACAATTGGATTTCTTAAGGAAGCTCCTCAA
atttcgtgcacctttaatttttatattattattattatttggattatctttgtagGGAACAGCTTTGACAGTCACAACAATTGGATTTCTTAAGGAAGCTCCTCAAGTCAATATCCATGGTTTCAATGTATATCACAAAAATCGGCTTATACTG
ctttaat putative branch site (score: 4)
ttatcttt putative PPT
tttaatttttatatta TA-rich tract