1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' |
gtaagattaagggttatctctttcttgtttatcttgttaatgctacagcaattacttatttgtttgaagtcacagtgatgattgctgttctgattttttggtcttttctctttttgttctcaatcgattggcttgatggaacatttaagTTCCCAAACGGCTGGCGAGTGGACAATTTATCCTTGGATTCACAGCAATTGCAATTCATTATCAGACAGTGATCAACTTCGTCCTGTTTCAATACCAGAT
species | Glycine max |
transcript | GLYMA20G16030.1 |
intron # | 11 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AATGAATTTTCATACTACATGATGATATGCTCGAGCTTTATTCTTAACCA TTCCCAAACGGCTGGCGAGTGGACAATTTATCCTTGGATTCACAGCAATTGEST: gi|308098770|gb|HO760511.1|HO760511
genomic: AATGAATTTTCATACTACATGATGATATGCTCGAGCTTTATTCTTAACCAgtaagattaa ... aacatttaagTTCCCAAACGGCTGGCGAGTGGACAATTTATCCTTGGATTCACAGCAATTG
EST: AATGAATTTTCATACTACATGATGATATGCTCGAGCTTTATTCTTAACCA TTCCCAAACGGCCGGCGAGTGGACAATTTATCCTTGGATTCACAGCAATTGEST: gi|7146905|gb|AW508827.1|AW508827
genomic: AATGAATTTTCATACTACATGATGATATGCTCGAGCTTTATTCTTAACCAgtaagattaa ... aacatttaagTTCCCAAACGGCTGGCGAGTGGACAATTTATCCTTGGATTCACAGCAATTG
EST: AATGAATTTTCATACTACATGATGATATGCTCGAGCTTTATTCTTAACCA TTCCCCAACGGCTGGCGAGTGGACAATTTATCCTTGGATTCACAGCAATTGEST: gi|9204212|gb|BE330436.1|BE330436
genomic: AATGAATTTTCATACTACATGATGATATGCTCGAGCTTTATTCTTAACCAgtaagattaa ... aacatttaagTTCCCAAACGGCTGGCGAGTGGACAATTTATCCTTGGATTCACAGCAATTG
EST: AATGAAGTTTCATACTACATGATGATATGCTCGAGCTTTATTCTTTACCA TTCCCAAACGGCTGGCGAGTGGACAATTTATCCTTGGATTCACAGCAATTG
genomic: AATGAATTTTCATACTACATGATGATATGCTCGAGCTTTATTCTTAACCAgtaagattaa ... aacatttaagTTCCCAAACGGCTGGCGAGTGGACAATTTATCCTTGGATTCACAGCAATTG
tttttggtcttttctctttttgttctcaatcgattggcttgatggaacatttaagTTCCCAAACGGCTGGCGAGTGGACAATTTATCCTTGGATTCACAGCAATTGCAATTCATTATCAGACAGTGATCAACTTCGTCCTGTTTCAATACCAGAT
gcttgat putative branch site (score: 5)
aacatttaa TA-rich tract