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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtgatttcctactccgagcaagaccatgatgtttgcagttttttctctgggtttcctaacgtaatatattccccttgttatagATGCTTGCAGAGATTGATGGGTTAAGTGATTCCACACAG

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA19G39580.1
intron # 11
splice site 3'
intron type U2


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

atgtttgcagttttttctctgggtttcctaacgtaatatattccccttgttatagATGCTTGCAGAGATTGATGGGTTAAGTGATTCCACACAG
                         tcctaac  putative branch site (score: 1)
                                        ttccccttgtt  putative PPT
                            taacgtaatatatt  TA-rich tract