1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' |
gttaaatgtttactctttattcttttttaaatatccattggttgtttaatgtctgtttatgcactcgttagagtctaacaattaattatgattgtaacattctgggcatttcagAATGATTTGGTCCATGGCTGGGGCCTTGATTTTGCTCTTAGAAAATGTGTTGAG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA05G30830.1 |
intron # | 11 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTCCAGTGTTTTCACGAGATGCATGGCATTGTGTGTGGCATATGATTCAG AATGATTTGGTCCATGGCTGGGGCCTTGATTTTGCTCTTAGAAAATGTGTTEST: gi|13312427|gb|BG406078.1|BG406078
genomic: CTCCAGTGTTTTCACGAGATGCATGGCATTGTGTGTGGCATATGATTCAGgttaaatgtt ... ggcatttcagAATGATTTGGTCCATGGCTGGGGCCTTGATTTTGCTCTTAGAAAATGTGTT
EST: ACGAGATGCATGGCATTGTGTGTGGCATATGATTCAG AATGATTTGGTCCATGGCTGGGGCCTTGATTTTGCTCTTAGAAAATGTGTTEST: gi|7146333|gb|AW508255.1|AW508255
genomic: ACGAGATGCATGGCATTGTGTGTGGCATATGATTCAGgttaaatgtt ... ggcatttcagAATGATTTGGTCCATGGCTGGGGCCTTGATTTTGCTCTTAGAAAATGTGTT
EST: CTCCAGTGTTTTCACGAGATGCATGGCATTGTGTGTGGCATATGATTCAG AATGATTTGGTCCATGGCTGGGGCCTTGATTTTGCTCTTAGAAAATGTGTTEST: gi|14009195|gb|BG725799.1|BG725799
genomic: CTCCAGTGTTTTCACGAGATGCATGGCATTGTGTGTGGCATATGATTCAGgttaaatgtt ... ggcatttcagAATGATTTGGTCCATGGCTGGGGCCTTGATTTTGCTCTTAGAAAATGTGTT
EST: GTTTTCACGAGATGCATGGCATTGTGTGTGGCATATGATTCAG AATGATTTGGTCCATGGCTGGGGCCTTGATTTTGCTCTTAGAAAATGTGTT
genomic: GTTTTCACGAGATGCATGGCATTGTGTGTGGCATATGATTCAGgttaaatgtt ... ggcatttcagAATGATTTGGTCCATGGCTGGGGCCTTGATTTTGCTCTTAGAAAATGTGTT
tgcactcgttagagtctaacaattaattatgattgtaacattctgggcatttcagAATGATTTGGTCCATGGCTGGGGCCTTGATTTTGCTCTTAGAAAATGTGTTGAG
ttgtaac putative branch site (score: 2)
taacaattaattatga TA-rich tract