1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
gtaagcttattgttccttctttttgtgtttaacaaaaaaaaaaaaaattagtttccctcttttcttcccctaattcatccattatagatgacatgcttttcaatgtaaaaagacatgattttccatgttgatatatgatccttgttagtaccttggctatgcttcatattaattaacaacacatcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCCTCAACAAAAATTCAGTGCCTG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA13G29410.1 |
intron # | 10 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|254330688|gb|GR841953.1|GR841953
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|58014729|gb|CX701471.1|CX701471
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|4437020|gb|AI522885.1|AI522885
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|209726322|gb|BW680234.1|BW680234
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|209729808|gb|BW658613.1|BW658613
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGGCTTGGCTTCTATAACCEST: gi|213593328|gb|DB975696.1|DB975696
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGTTTGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|19052654|gb|BM731321.1|BM731321
genomic: TGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTAGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|254346600|gb|GR856322.1|GR856322
genomic: TCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|209698391|gb|BW667186.1|BW667186
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|15815903|gb|BI788178.1|BI788178
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|214009429|gb|DB990635.1|DB990635
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTTCTGAACGTAGTGACAAGCATCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|20075616|gb|BQ094399.1|BQ094399
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: CCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|58018378|gb|CX705120.1|CX705120
genomic: CCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|254335575|gb|GR847103.1|GR847103
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|254345540|gb|GR851702.1|GR851702
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|254333982|gb|GR848900.1|GR848900
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|213597480|gb|DB981648.1|DB981648
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|298170634|gb|HO019258.1|HO019258
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|214009268|gb|DB990600.1|DB990600
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTCTGGTGGTAGTGACAGT-ATCCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|213594872|gb|DB977214.1|DB977214
genomic: TTCTGGTGGTAGTGACAATCA-CCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTCTGGTGGTAGTGAC-ATTAGTCTGGTTCTTGTCGATCTAGGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|9819792|gb|BE555305.1|BE555305
genomic: TTCTGGTGGTAGTGACAATCA-CCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|192301793|gb|FG994445.1|FG994445
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|7591183|gb|AW706921.1|AW706921
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTEST: gi|58023902|gb|CX710643.1|CX710643
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTT
EST: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|18735429|gb|BM528760.1|BM528760
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAA-TTCTTGACTTGGCTTCTATA-CCEST: gi|254346462|gb|GR856184.1|GR856184
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|209722222|gb|BW662394.1|BW662394
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|209725263|gb|BW672738.1|BW672738
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: CGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|10254054|gb|BE821820.1|BE821820
genomic: CGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|58014732|gb|CX701474.1|CX701474
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|298186489|gb|HO037122.1|HO037122
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCEST: gi|209725542|gb|BW677842.1|BW677842
genomic: TTTCTGGTGGTAGTGACAATCACCTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
EST: CTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCT GGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
genomic: CTGGTTCTTGTCGATCTAAGGCCATCTgtaagcttat ... catcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACC
gatccttgttagtaccttggctatgcttcatattaattaacaacacatcctttagGGTCTTGATGGTGCTCGGGTGGAGAAAATTCTTGACTTGGCTTCTATAACCCTCAACAAAAATTCAGTGCCTG
aattaac putative branch site (score: 2)
catccttt putative PPT
ttcatattaattaaca TA-rich tract