1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' |
gtgagtgatttcttggaagatctcccttcgacaatatcacaaagcttgtttttgatctcataatacatgattgatgcttttcttattaaactaatgcaacattttcacttctttgcagGTAGCTCGAGGTGATAGGAGTGGAGAAGATGGTATCCCTATGCTACTCAAGATACCACGTATGTTTGATCCTTGGGGTGGTTACAGCATCATTGGTTTTG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA09G39500.1 |
intron # | 10 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TGATGATAGTG GTAGCTCGAGGTGATAGGAGTGGAGAAGATGGTATCCCTATGCTACTCAAGEST: gi|193668696|gb|FK608216.1|FK608216
genomic: TGATGATAGTGgtgagtgatt ... ttctttgcagGTAGCTCGAGGTGATAGGAGTGGAGAAGATGGTATCCCTATGCTACTCAAG
EST: TCTGGGTGTTTGTCTCTAAATGGTGGTTCCATGAGAGTGTGATGATAGTG GTAGTTCGAGGTGATAGGAGTGGAGAAGATGGTATCCCTATGCTACTEST: gi|9900391|gb|BE609359.1|BE609359
genomic: TCTGGGTGTTTGTCTCTAAATGGTGGTTCCATGAGAGTGTGATGATAGTGgtgagtgatt ... ttctttgcagGTAGCTCGAGGTGATAGGAGTGGAGAAGATGGTATCCCTATGCTACT
EST: TCTGGGTGTTTGTCTCTAAATGGTGGTTCCATGAGAGTGTGATGATAGTG GTAGCTCGAGGTGATAGGAGTGGAGAAGATGGTATCCCTATGCTACTCAAGEST: gi|9258837|gb|BE346984.1|BE346984
genomic: TCTGGGTGTTTGTCTCTAAATGGTGGTTCCATGAGAGTGTGATGATAGTGgtgagtgatt ... ttctttgcagGTAGCTCGAGGTGATAGGAGTGGAGAAGATGGTATCCCTATGCTACTCAAG
EST: CTAAATGGTGGTTCCATGAGAGTGTGATGATAGTG GTAGCTCGAGGTGATAGGAGTGGAGAAGATGGTATCCCTATGCTACTCAAGEST: gi|193645974|gb|FK593903.1|FK593903
genomic: CTAAATGGTGGTTCCATGAGAGTGTGATGATAGTGgtgagtgatt ... ttctttgcagGTAGCTCGAGGTGATAGGAGTGGAGAAGATGGTATCCCTATGCTACTCAAG
EST: TCTGGGTGTTTGTCTCTAAATGGTGGTTCCATGAGAGTGTGATGATAGTG GTAGCTCGAGGTGATAGGAGTGGAGAAGATGGTACCCCTATGCTACTCAAGEST: gi|208299697|gb|GE097180.1|GE097180
genomic: TCTGGGTGTTTGTCTCTAAATGGTGGTTCCATGAGAGTGTGATGATAGTGgtgagtgatt ... ttctttgcagGTAGCTCGAGGTGATAGGAGTGGAGAAGATGGTATCCCTATGCTACTCAAG
EST: TCTGGGTGTTTGTCTCTAAATGGTGGTTCCATGAGAGTGTGATGATAGTG GTAGCTCGAGGTGATAGGAGTGGAGAAGATGGTATCCCTATGCTACTCAAGEST: gi|22524144|gb|BU082955.1|BU082955
genomic: TCTGGGTGTTTGTCTCTAAATGGTGGTTCCATGAGAGTGTGATGATAGTGgtgagtgatt ... ttctttgcagGTAGCTCGAGGTGATAGGAGTGGAGAAGATGGTATCCCTATGCTACTCAAG
EST: TCTGGGTGTTTGTCTCTAAATGGTGGTTCCATGAGAGTGTGATGATAGTG GTAGCTCGAGGTGATAGGAGTGGAGAAGATGGTATCCCTATGCTACTCAAGEST: gi|22523945|gb|BU082756.1|BU082756
genomic: TCTGGGTGTTTGTCTCTAAATGGTGGTTCCATGAGAGTGTGATGATAGTGgtgagtgatt ... ttctttgcagGTAGCTCGAGGTGATAGGAGTGGAGAAGATGGTATCCCTATGCTACTCAAG
EST: TCTGGGTGTTTGTCTCTAAATGGTGGTTCCATGAGAGTGTGATGATAGTG GTAGCTCGAGGTGATAGGAGTGGAGAAGATGGTATCCCTATGCTACTCAAGEST: gi|254320215|gb|GR829403.1|GR829403
genomic: TCTGGGTGTTTGTCTCTAAATGGTGGTTCCATGAGAGTGTGATGATAGTGgtgagtgatt ... ttctttgcagGTAGCTCGAGGTGATAGGAGTGGAGAAGATGGTATCCCTATGCTACTCAAG
EST: TCTGGGTGTTTGTCTCTAAATGGTGGTTCCATGAGAGTGTGATGATAGTG GTAGCTCGAGGTGATAGGAGTGGAGAAGATGGTATCCCTATGCTACTCAAG
genomic: TCTGGGTGTTTGTCTCTAAATGGTGGTTCCATGAGAGTGTGATGATAGTGgtgagtgatt ... ttctttgcagGTAGCTCGAGGTGATAGGAGTGGAGAAGATGGTATCCCTATGCTACTCAAG
tacatgattgatgcttttcttattaaactaatgcaacattttcacttctttgcagGTAGCTCGAGGTGATAGGAGTGGAGAAGATGGTATCCCTATGCTACTCAAGATACCACGTATGTTTGATCCTTGGGGTGGTTACAGCATCATTGGTTTTG
aactaat putative branch site (score: 2)
cattttcacttcttt putative PPT
ttttcttattaaacta TA-rich tract