Mapped EST sequences
Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments
ATGC EST sequence
ATGC genomic sequence (exon)
ATGC genomic sequence (truncated intron)
EST:
gi|6454146|gb|AW184894.1|AW184894EST: CACCTGGCAACAAGCTTGACAACAAACGCCTTGCACTGGCCCTTAAGAAG GAATTTGATTCTTCGTATGGTCCAGCTTGGCACTGCATTGTGGGTACTAGC
genomic: CACCTGGCAACAAGCTTGACAACAAACGCCTTGCACTGGCCCTTAAGAAGgttacattaa ... actcttacagGAATTTGATTCTTCGTATGGTCCAGCTTGGCACTGCATTGTGGGTACTAGC
EST:
gi|6455693|gb|AW186376.1|AW186376EST: CACCTGGCAACAAGCTTGACAACAAACGCCTTGCACTGGCCCTTAAGAAG GAATTTGATTCTTCGTATGGTCCAGCTTGGCACTGCATTGTGGGTACTAGC
genomic: CACCTGGCAACAAGCTTGACAACAAACGCCTTGCACTGGCCCTTAAGAAGgttacattaa ... actcttacagGAATTTGATTCTTCGTATGGTCCAGCTTGGCACTGCATTGTGGGTACTAGC
EST:
gi|298166224|gb|HO009195.1|HO009195EST: CACCTGGCAACAAGCTTGACAACAAACGCCTTGCACTGGCCCTTAAGAAG GAATTTGATTCTTCGTATGGTCCAGCTTGGCACTGCATTGTGGGTACTAGC
genomic: CACCTGGCAACAAGCTTGACAACAAACGCCTTGCACTGGCCCTTAAGAAGgttacattaa ... actcttacagGAATTTGATTCTTCGTATGGTCCAGCTTGGCACTGCATTGTGGGTACTAGC
EST:
gi|13312100|gb|BG405751.1|BG405751EST: CACCTGGCAACAAGCTTGACAACAAACGCCTTGCACTGGCCCTTAAGAAG GAATTTGATTCTTCGTATGGTCCAGCTTGGCACTGCATTGTGGGTACTAGC
genomic: CACCTGGCAACAAGCTTGACAACAAACGCCTTGCACTGGCCCTTAAGAAGgttacattaa ... actcttacagGAATTTGATTCTTCGTATGGTCCAGCTTGGCACTGCATTGTGGGTACTAGC
EST:
gi|298194715|gb|HO043187.1|HO043187EST: CACCTGGCAACAAGCTTGACAACAAACGCCTTGCACTGGCCCTTAAGAAG GAATTTGATTCTTCGTATGGTCCAGCTTGGCACTGCATTGTGGGTACTAGC
genomic: CACCTGGCAACAAGCTTGACAACAAACGCCTTGCACTGGCCCTTAAGAAGgttacattaa ... actcttacagGAATTTGATTCTTCGTATGGTCCAGCTTGGCACTGCATTGTGGGTACTAGC
EST:
gi|298165641|gb|HO011690.1|HO011690EST: CACCTGGCAACAAGCTTGACAACAAACGCCTTGCACTGGCCCTTAAGAAG GAATTTGATTCTTCGTATGGTCCAGCTTGGCACTGCATTGTGGGTACTAGC
genomic: CACCTGGCAACAAGCTTGACAACAAACGCCTTGCACTGGCCCTTAAGAAGgttacattaa ... actcttacagGAATTTGATTCTTCGTATGGTCCAGCTTGGCACTGCATTGTGGGTACTAGC
EST:
gi|298190386|gb|HO032507.1|HO032507EST: CACCTGGCAACAAGCTTGACAACAAACGCCTTGCACTGGCCCTTAAGAAG GAATTTGATTCTTCGTATGGTCCAGCTTGGCACTGCATTGTGGGTACTAGC
genomic: CACCTGGCAACAAGCTTGACAACAAACGCCTTGCACTGGCCCTTAAGAAGgttacattaa ... actcttacagGAATTTGATTCTTCGTATGGTCCAGCTTGGCACTGCATTGTGGGTACTAGC
EST:
gi|9987355|gb|BE661463.1|BE661463EST: CACCTGGCAACAAGCTTGACAACAAACGCCTTGCACTGGCCCTTAAGAAG GAATTTGATTCTTCGTATGGTCCAGCTTGGCACTGCATTGTGGGTACTAGC
genomic: CACCTGGCAACAAGCTTGACAACAAACGCCTTGCACTGGCCCTTAAGAAGgttacattaa ... actcttacagGAATTTGATTCTTCGTATGGTCCAGCTTGGCACTGCATTGTGGGTACTAGC
atgc intronic sequence ATGC exonic sequenceIntronic sequence truncated to 55 bases.cttgttacctagtatgaactacttggatggctaatgatacaaagtactcttacagGAATTTGATTCTTCGTATGGTCCAGCTTGGCACTGCATTGTGGGTACTAGCTTTGGTTCTTATGTTACACATTCTGTTGGTGGCTTTTTGTACTTTTCCA
ggctaat putative branch site (score: 3)
tactctt putative PPT
taatgata TA-rich tract