1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
...tttgtattttgaaggattaatttcgttttgatcgcgctgatttttgaactgtaggtgactgtttctttgttgattgatgctcatttttgtggtgttgcagATAATTTCTCCGTATCATTTGTACTTGAACCCTAGATTGGTGGTGAAGCAATATCAGTTTTGGCGTCTGGTTACTAATTTCTTGTACTTTCGTAAAATGG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA15G11350.3 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GCTCTTATCTCACCGCTGCTGTTGTCACCACCATCGGATGTTCCCTTGAT ATAATTTCTCCGTATCATTTGTACTTGAACCCTAGATTGGTGGTGAAGCAAEST: gi|9203644|gb|BE329868.1|BE329868
genomic: GCTCTTATCTCACCGCTGCTGTTGTCACCACCATCGGATGTTCCCTTGATgtaatcccct ... ggtgttgcagATAATTTCTCCGTATCATTTGTACTTGAACCCTAGATTGGTGGTGAAGCAA
EST: GCTCTTATCTCACCGCTGCTGTTGTCACCACCATCGGATGTTCCCTTGAT ATAATTTCTCCGTATCATTTGTACTTGAACCCTAGATTGGTGGTGAAGCAAEST: gi|254322572|gb|GR837986.1|GR837986
genomic: GCTCTTATCTCACCGCTGCTGTTGTCACCACCATCGGATGTTCCCTTGATgtaatcccct ... ggtgttgcagATAATTTCTCCGTATCATTTGTACTTGAACCCTAGATTGGTGGTGAAGCAA
EST: GCTCTTATCTCACCGCTGCTGTTGTCACCACCATCGGATGTTCCCTTGAT ATAATTTCTCCGTATCATTTGTACTTGAACCCTAGATTGGTGGTGAAGCAAEST: gi|213590246|gb|DB970086.1|DB970086
genomic: GCTCTTATCTCACCGCTGCTGTTGTCACCACCATCGGATGTTCCCTTGATgtaatcccct ... ggtgttgcagATAATTTCTCCGTATCATTTGTACTTGAACCCTAGATTGGTGGTGAAGCAA
EST: GCTCTTATCTCACCGCTGCTGTTGTCACCACCATCGGATGTTCCCTTGAT ATAATTTCTCCGTATCATTTGTACTTGAACCCTAGATTGGTGGTGAAGCAAEST: gi|19453304|gb|BM954714.1|BM954714
genomic: GCTCTTATCTCACCGCTGCTGTTGTCACCACCATCGGATGTTCCCTTGATgtaatcccct ... ggtgttgcagATAATTTCTCCGTATCATTTGTACTTGAACCCTAGATTGGTGGTGAAGCAA
EST: GCTCTTATCTCACCGCTGCTGTTGTCACCACCATCGGATGTTCCCTTGAT ATAATTTCTCCGTATCATTTGTACTTGAACCCTAGATTGGTGGTGAAGCAAEST: gi|213598283|gb|DB970167.1|DB970167
genomic: GCTCTTATCTCACCGCTGCTGTTGTCACCACCATCGGATGTTCCCTTGATgtaatcccct ... ggtgttgcagATAATTTCTCCGTATCATTTGTACTTGAACCCTAGATTGGTGGTGAAGCAA
EST: GCTCTTATCTCACCGCTGCTGTTGTCACCACCATCGGATGTTCCCTTGAT ATAATTTCTCCGTATCATTTGTACTTGAACCCTAGATTGGTGGTGAAGCAAEST: gi|16348305|gb|BI973900.1|BI973900
genomic: GCTCTTATCTCACCGCTGCTGTTGTCACCACCATCGGATGTTCCCTTGATgtaatcccct ... ggtgttgcagATAATTTCTCCGTATCATTTGTACTTGAACCCTAGATTGGTGGTGAAGCAA
EST: GCTCTTATCTCACCGCTGCTGTTGTCACCACCATCGGATGTTCCCTTGAT ATAATTTCTCCGTATCATTTGTACTTGAACCCTAGATTGGTGGTGAAGCAAEST: gi|254327112|gb|GR836721.1|GR836721
genomic: GCTCTTATCTCACCGCTGCTGTTGTCACCACCATCGGATGTTCCCTTGATgtaatcccct ... ggtgttgcagATAATTTCTCCGTATCATTTGTACTTGAACCCTAGATTGGTGGTGAAGCAA
EST: GCTCTTATCTCACCGCTGCTGTTGTCACCACCATCGGATGTTCCCTTGAT ATAATTTCTCCGTATCATTTGTACTTGAACCCTAGATTGGTGGTGAAGCAAEST: gi|18733025|gb|BM527383.1|BM527383
genomic: GCTCTTATCTCACCGCTGCTGTTGTCACCACCATCGGATGTTCCCTTGATgtaatcccct ... ggtgttgcagATAATTTCTCCGTATCATTTGTACTTGAACCCTAGATTGGTGGTGAAGCAA
EST: GCTCTTATCTCACCGCTGCTGTTGTCACCACCATCGGATGTTCCCTTGAT ATAATTTCTCCGTATCATTTGTACTTGAACCCTAGATTGGTGGTGAAGCAA
genomic: GCTCTTATCTCACCGCTGCTGTTGTCACCACCATCGGATGTTCCCTTGATgtaatcccct ... ggtgttgcagATAATTTCTCCGTATCATTTGTACTTGAACCCTAGATTGGTGGTGAAGCAA
gaactgtaggtgactgtttctttgttgattgatgctcatttttgtggtgttgcagATAATTTCTCCGTATCATTTGTACTTGAACCCTAGATTGGTGGTGAAGCAATATCAGTTTTGGCGTCTGGTTACTAATTTCTTGTACTTTCGTAAAATGG
gattgat putative branch site (score: 4)
tcattttt TA-rich tract