1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtacgctattagaattcttcttttctcttctcgatcccttcactggtccacttttcctttgtttttgtttttgtctgataattttcaaaaccctaatttctgtgtagGAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCGTGGATGAGTACACCGTTCGCGTTGTGGATGTGTTTGCGATGCCTCAGAG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA14G08940.1 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACG GAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCGEST: gi|298190679|gb|HO032800.1|HO032800
genomic: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACGgtacgctatt ... ttctgtgtagGAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCG
EST: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACG GAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCGEST: gi|12773252|gb|BG238179.1|BG238179
genomic: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACGgtacgctatt ... ttctgtgtagGAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCG
EST: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACG GAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCGEST: gi|192300390|gb|FG991462.1|FG991462
genomic: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACGgtacgctatt ... ttctgtgtagGAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCG
EST: CGAGCAGGCCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACG GAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCGEST: gi|151394289|gb|EV264160.1|EV264160
genomic: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACGgtacgctatt ... ttctgtgtagGAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCG
EST: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACG GAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGCTGGGGGAGTTCGEST: gi|213602552|gb|DB956572.1|DB956572
genomic: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACGgtacgctatt ... ttctgtgtagGAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCG
EST: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACG GAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCGEST: gi|254326087|gb|GR840679.1|GR840679
genomic: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACGgtacgctatt ... ttctgtgtagGAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCG
EST: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACG GAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCGEST: gi|120494533|gb|EH222700.1|EH222700
genomic: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACGgtacgctatt ... ttctgtgtagGAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCG
EST: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACG GAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCGEST: gi|6341699|gb|AW164585.1|AW164585
genomic: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACGgtacgctatt ... ttctgtgtagGAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCG
EST: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACG GAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCGEST: gi|213599137|gb|DB962230.1|DB962230
genomic: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACGgtacgctatt ... ttctgtgtagGAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCG
EST: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACG GAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCGEST: gi|192303126|gb|FG994244.1|FG994244
genomic: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACGgtacgctatt ... ttctgtgtagGAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCG
EST: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACG GAAGAGCTGGGG-ACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGT-GGGGGAEST: gi|8669760|gb|BE190867.1|BE190867
genomic: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACGgtacgctatt ... ttctgtgtagGAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGA
EST: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACG GAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCGEST: gi|23725587|gb|BU760753.1|BU760753
genomic: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACGgtacgctatt ... ttctgtgtagGAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCG
EST: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACG GAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCGEST: gi|298182393|gb|HO026568.1|HO026568
genomic: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACGgtacgctatt ... ttctgtgtagGAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCG
EST: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACG GAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCGEST: gi|209698688|gb|BW656513.1|BW656513
genomic: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACGgtacgctatt ... ttctgtgtagGAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCG
EST: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACG GAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCGEST: gi|298190950|gb|HO038429.1|HO038429
genomic: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACGgtacgctatt ... ttctgtgtagGAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCG
EST: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACG GAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCGEST: gi|298195630|gb|HO044021.1|HO044021
genomic: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACGgtacgctatt ... ttctgtgtagGAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCG
EST: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACG GAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCGEST: gi|151394039|gb|EV263910.1|EV263910
genomic: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACGgtacgctatt ... ttctgtgtagGAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCG
EST: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCATCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACG GAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCG
genomic: CGAGCAGGTCTACATCTCCTCCCTCGCCCTTCTCAAAATGCTCAAACACGgtacgctatt ... ttctgtgtagGAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCG
tttcctttgtttttgtttttgtctgataattttcaaaaccctaatttctgtgtagGAAGAGCTGGGGTACCCATGGAAGTGATGGGTCTGATGTTGGGGGAGTTCGTGGATGAGTACACCGTTCGCGTTGTGGATGTGTTTGCGATGCCTCAGAG
ccctaat putative branch site (score: 3)
tttctgt CT-rich tract
tttgtttttgttttt TA-rich tract