1 5' 3' | 2 5' 3' |
gtatagtcaatagtgataattaattaatttcaattctctgaatattgattctgtgcttcagctgaaaatgttgtgtttgtgtgaattgtttatagATATGATTGAAGAGTTGATCAGCAAAGGGCAGCAGCTTGATGCGGTTCACTTTACATATGAAGTGGGTCTTGTGGAAAAGTTCCCTCCTGTTCCCTTGTT
species | Glycine max |
transcript | GLYMA10G39330.1 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ACAGATGCCGAAGCTCGCGCTTTCGGTTGGTCTCGCTCAGCAAATGCCTG ATATGATTGAAGAAGT-GATCAGCAAATGGCAGCAGCTTGATEST: gi|15204068|gb|BI426836.1|BI426836
genomic: ACAGATGCCGAAGCTCGCGCTTTCGCTTGGTCTCGCTCAGCAAATGCCTGgtatagtcaa ... ttgtttatagATATGATTGAAGA-GTTGATCAGCAAAGGGCAGCAGCTTGAT
EST: ACAGATGCCGAAGCTCGCGCTTTCGCTTGGTCTCGCTCAGCAAATGCCTG ATATGATTGAAGAGTTGATCAGCAAAGGGCAGCAGCTTGATGCGGNTCACTEST: gi|15201230|gb|BI424763.1|BI424763
genomic: ACAGATGCCGAAGCTCGCGCTTTCGCTTGGTCTCGCTCAGCAAATGCCTGgtatagtcaa ... ttgtttatagATATGATTGAAGAGTTGATCAGCAAAGGGCAGCAGCTTGATGCGGTTCACT
EST: ACAGATGCCGAAGCTCGCGCTTTCGCTTGGTCTCGCTCAGCAAATGCCTG ATATGATTGAAGAGTTGATCAGCAAAGGGCAGCAGCTTGATGCGGTTCACTEST: gi|193343737|gb|FK311497.1|FK311497
genomic: ACAGATGCCGAAGCTCGCGCTTTCGCTTGGTCTCGCTCAGCAAATGCCTGgtatagtcaa ... ttgtttatagATATGATTGAAGAGTTGATCAGCAAAGGGCAGCAGCTTGATGCGGTTCACT
EST: ACAGATGCCGAAGCTCGCGCTTTCGCTTGGTCTCGCTCAGCAAATGCCTG ATATGATTGAAGAGTTGATCAGEST: gi|208191461|gb|GD987881.1|GD987881
genomic: ACAGATGCCGAAGCTCGCGCTTTCGCTTGGTCTCGCTCAGCAAATGCCTGgtatagtcaa ... ttgtttatagATATGATTGAAGAGTTGATCAG
EST: ACAGATGCCGAAGCTCGCGCTTTCGCTTGGTCTCGCTCAGCAAATGCCTG ATATGATTGAAGAGTTGATCAGCAAAGGGCAGCAGCTTGATGCGGTTCACTEST: gi|151400897|gb|EV270711.1|EV270711
genomic: ACAGATGCCGAAGCTCGCGCTTTCGCTTGGTCTCGCTCAGCAAATGCCTGgtatagtcaa ... ttgtttatagATATGATTGAAGAGTTGATCAGCAAAGGGCAGCAGCTTGATGCGGTTCACT
EST: ACAGATGCCGAAGCTCGCGCTTTCGCTTGGTCTCGCTCAGCAAATGCCTG ATATGATTGAAGAGTTGATCAGCAAAGGGCAGCAGCTTGATGCGGTTCACT
genomic: ACAGATGCCGAAGCTCGCGCTTTCGCTTGGTCTCGCTCAGCAAATGCCTGgtatagtcaa ... ttgtttatagATATGATTGAAGAGTTGATCAGCAAAGGGCAGCAGCTTGATGCGGTTCACT
aatattgattctgtgcttcagctgaaaatgttgtgtttgtgtgaattgtttatagATATGATTGAAGAGTTGATCAGCAAAGGGCAGCAGCTTGATGCGGTTCACTTTACATATGAAGTGGGTCTTGTGGAAAAGTTCCCTCCTGTTCCCTTGTT
tattgat putative branch site (score: 3)
aattgtttata TA-rich tract