Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   		14  
 5'  3'   		15  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtttccctctacaaccctaattccatctcaatttttctatatcagaattcctattgtgaattatagtagttttaagtgatctaagtgctctaagatgcagGGCTAACTGGAGTGGATTTGCTCATGTATGATCTCAAGGCTTTTGAAGCTTATGCTTCTTACTTCTACTATTTCTCTAAGCTTTGGACCAGGCCGCTCCC

Basic information

species Glycine max
transcript GLYMA10G35610.1
intron # 1
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|209696682|gb|BW666951.1|BW666951
EST:     TACCTCTCCTCCTCTTCCTTCTCCTTCCTGGCCCCAACCTTGTTACCCAG                         GGCTAACTGGAGTGGATTTGCTCATGTATGATCTCAAGGCTTTTGAAGCTT
genomic: TACCTCTCCTCCTCTTCCTTCTCCTTCCTGGCCCCAACCTTGTTACCCAGgtttccctct ... taagatgcagGGCTAACTGGAGTGGATTTGCTCATGTATGATCTCAAGGCTTTTGAAGCTT






















 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

aattcctattgtgaattatagtagttttaagtgatctaagtgctctaagatgcagGGCTAACTGGAGTGGATTTGCTCATGTATGATCTCAAGGCTTTTGAAGCTTATGCTTCTTACTTCTACTATTTCTCTAAGCTTTGGACCAGGCCGCTCCC
             aattatagtagtttta  TA-rich tract