1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
...tattgttttaatgttgttgaattgtttgttagcttttctatttaacattggctgtagtgttattttatggcatggttgagatctctctttgctttttcagGTGACATTCATGGGCAGTACAGTGATTTGTTAAGGCTATTTGAGTATGGGGGTTTGCCTCCTACTGCGAATTATCTCTTTTTGGGGGACTACGTGGACCG
species | Glycine max |
transcript | GLYMA02G41890.1 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CATTAACCAGCCCAATTTGCTTGAACTCGAAGCCCCCATCAAGATTTGTG GTGACATTCATGGGCAGTACAGTGATTTGTTAAGGCTATTTGAG-ATGGGGEST: gi|298181712|gb|HO025887.1|HO025887
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EST: CATTAACCAGCCCAATTTGCTTGAACTCGAAGCCCCCATCAAGATTTGTG GTGACATTCATGGGCAGTACAGTGATTTGTTAAGGCTATTTGAGTATGGGGEST: gi|208167315|gb|GD958737.1|GD958737
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EST: CATTAACCAGCCCAATTTGCTTGAACTCGAGGCCCCCATCAAGATTTGTG GTGACATTCATGGGCAGTACAGTGATTTGTTAAGGCTATTTGAGTATGGGGEST: gi|192325314|gb|FK017130.1|FK017130
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cattggctgtagtgttattttatggcatggttgagatctctctttgctttttcagGTGACATTCATGGGCAGTACAGTGATTTGTTAAGGCTATTTGAGTATGGGGGTTTGCCTCCTACTGCGAATTATCTCTTTTTGGGGGACTACGTGGACCG
tctctctttgcttttt CT-rich tract
tagtgttattttat TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| tattgttttaatgttgttgaattgtttgttagcttttctatttaacattggctgtagtgttattttatggcatggttgagatctctctttgctttttcagGTGACATTCATGGGCAGTACAGTGATTTGTTAAGGCTATTTGAGTATGGGGGTTTGCCTCCTACTGCGAATTATCTCTTTTTGGGGGACTACGTGGACCG
- - - - - - gttgttg
- - - - - - - - - - - tgtttgt
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- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -gcatggt