1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
...ctctcttcaatcaaatcaatgaattttccacttgggaaaatgggaatcttgattttgtttactgtgagttgaactttgcgatggaattgctttgtttcagGGATTTATGGTGCCATGGCTGTTGCGGGGAGTTTTATATGTTCAATCACGGGAATTGACTCTCTGGGTGGTTTCCATCTATCGTTAGATGCCATTTTGGA
species | Glycine max |
transcript | GLYMA01G40650.3 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TCCCGTTTGGGAAAAGATTGGTGCTGTCGTCAGACTCAGTTATGGTATCG GGATTTATGGTGCCATGGCTGTTGCGGGGAGTTTTATATGTTCAATCACGGEST: gi|20813512|gb|BQ297990.1|BQ297990
genomic: TCCCGTTTGGGAAAAGATTGGTGCTGTCGTCAGACTCAGTTATGGTATCGgtgagtgagt ... tttgtttcagGGATTTATGGTGCCATGGCTGTTGCGGGGAGTTTTATATGTTCAATCACGG
EST: TCCCGTTTGGGAAAAGATTGGTGCTGTCGTCAGACTCAGTTATGGTATCG GGATTTATGGTGCCATGGCTGTTGCGGGGAGTTTTATATGTTCAATCACGGEST: gi|20811609|gb|BQ296087.1|BQ296087
genomic: TCCCGTTTGGGAAAAGATTGGTGCTGTCGTCAGACTCAGTTATGGTATCGgtgagtgagt ... tttgtttcagGGATTTATGGTGCCATGGCTGTTGCGGGGAGTTTTATATGTTCAATCACGG
EST: TCCCGTTTGGGAAAAGATTGGTGCTGTCGTCAGACTCAGTTATGGTATCG GGATTTATGGTGCCATGGCTGTTGCGGGGAGTTTTATATGTTCAATCACGGEST: gi|17022600|gb|BM093634.1|BM093634
genomic: TCCCGTTTGGGAAAAGATTGGTGCTGTCGTCAGACTCAGTTATGGTATCGgtgagtgagt ... tttgtttcagGGATTTATGGTGCCATGGCTGTTGCGGGGAGTTTTATATGTTCAATCACGG
EST: CTGTCGTCAGACTCAGTTATGGTATCG GGATTTATGGTGCCATGGCTGTTGCGGGGAGTTTTATATGTTCAATCACGG
genomic: CTGTCGTCAGACTCAGTTATGGTATCGgtgagtgagt ... tttgtttcagGGATTTATGGTGCCATGGCTGTTGCGGGGAGTTTTATATGTTCAATCACGG
atcttgattttgtttactgtgagttgaactttgcgatggaattgctttgtttcagGGATTTATGGTGCCATGGCTGTTGCGGGGAGTTTTATATGTTCAATCACGGGAATTGACTCTCTGGGTGGTTTCCATCTATCGTTAGATGCCATTTTGGA
tcttgat putative branch site (score: 4)
ctttgtttc putative PPT
attttgttta TA-rich tract