1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
gtatatatgtttctaagaaagagctgtttgtcatccttgactagtcttatcagccattgttttgtgtaacgtttggttttaattttgcattgagcagCCAATGATCTATGGTAGAGGAGCAATGCCAACAGGGATGCAAATGGTTCCAATGCTTCTTCCCGATGGCCGAGTTGGCTATGTTCT
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT4G00830.3 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTTACGGTGCTATGGGTGCCGGTTTGGGTATTGCCGGTAGTTTTAGTCAG CCAATGATCTATGGTAGAGGAGCAATGCCAACAGGGATGCAAATGGTTCCAEST: gi|47828154|gb|CK117838.1|CK117838
genomic: CTTACGGTGCTATGGGTGCCGGTTTGGGTATTGCCGGTAGTTTTAGTCAGgtatatatgt ... cattgagcagCCAATGATCTATGGTAGAGGAGCAATGCCAACAGGGATGCAAATGGTTCCA
EST: CTTACGGTGCTATGGGTGCCGGTTTGGGTATTGCCGGTAGTTTTAGTCAG CCAATGATCTATGGTAGAGGAGCAATGCCAACAGGGATGCAAATGGTTCCAEST: gi|125033917|gb|EL106186.1|EL106186
genomic: CTTACGGTGCTATGGGTGCCGGTTTGGGTATTGCCGGTAGTTTTAGTCAGgtatatatgt ... cattgagcagCCAATGATCTATGGTAGAGGAGCAATGCCAACAGGGATGCAAATGGTTCCA
EST: GGGTGCCGGTTTGGGTATTGCCGGTAGTTTTAGTCAG CCAATGATCTATGGTAGAGGAGCAATGCCAACAGGGATGCAAATGGTTCCA
genomic: GGGTGCCGGTTTGGGTATTGCCGGTAGTTTTAGTCAGgtatatatgt ... cattgagcagCCAATGATCTATGGTAGAGGAGCAATGCCAACAGGGATGCAAATGGTTCCA
agtcttatcagccattgttttgtgtaacgtttggttttaattttgcattgagcagCCAATGATCTATGGTAGAGGAGCAATGCCAACAGGGATGCAAATGGTTCCAATGCTTCTTCCCGATGGCCGAGTTGGCTATGTTCT
ttttaat putative branch site (score: 3)
tttggttttaatttt TA-rich tract