1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' |
gtaagtttctttctcaagcaacacagtactggattattcatggtaggtgacttttctgataccatttttctctattctgccattcttagGTTGGTCAGTTGAGGTTAACACCTCGGGTCCTTGTTGGTCATAGCTTTGGGGGGAAAG
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT4G10030.1 |
intron # | 6 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AGAGAGGTCCACACTCGGTTGCTACTACTGCTTCTGATGTTCTAAAACTT GTTGGTCAGTTGAGGTTAACACCTCGGGTCCTTGTTGGTCATAGCTTTGEST: gi|86019776|gb|DR315522.1|DR315522
genomic: AGAGAGGTCCACACTCGGTTGCTACTACTGCTTCTGATGTTCTAAAACTTgtaagtttct ... ccattcttagGTTGGTCAGTTGAGGTTAACACCTCGGGTCCTTGTTGGTCATAGCTTTG
EST: AGAGAGGTCCACACTCGGTTGCTACTACTGCTTCTGATGTTCTAAAACTT GTTGGTCAGTTNNNNNTAACACCTCGGGTCCTTGTTGGTCATAGNTTTGGG
genomic: AGAGAGGTCCACACTCGGTTGCTACTACTGCTTCTGATGTTCTAAAACTTgtaagtttct ... ccattcttagGTTGGTCAGTTGAGGTTAACACCTCGGGTCCTTGTTGGTCATAGCTTTGGG
tattcatggtaggtgacttttctgataccatttttctctattctgccattcttagGTTGGTCAGTTGAGGTTAACACCTCGGGTCCTTGTTGGTCATAGCTTTGGGGGGAAAG
ttctgat putative branch site (score: 3)
tttttctctattctgc putative PPT
atttttct TA-rich tract