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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gttaaataacattctttattttcaccaattgtttcattcatgatgatatttttcgttaatgtaaaactgttgatttgctggatgaacttttgcagTAGTTACCAAGCCACAAGTCACGGCAAAAACTCCTTGGTTCAAATCAAAATCTATTATTAAG

Basic information

species Arabidopsis thaliana
transcript AT4G05520.1
intron # 6
splice site 3'
intron type U2


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tgatgatatttttcgttaatgtaaaactgttgatttgctggatgaacttttgcagTAGTTACCAAGCCACAAGTCACGGCAAAAACTCCTTGGTTCAAATCAAAATCTATTATTAAG
                           tgttgat  putative branch site (score: 4)
                                              cttttgc  putative PPT
     atatttttcgttaatg  TA-rich tract