1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
gtttgagtctaattctaacaacattcaccaaaagaaaatgaaatggctgaaataatttcttatcaaagttgattatgtacagGAGCCTGTGCTTCCGGGTTGTTTTCTTCGCGCCCGAGCTATTGGTTTAATGCCTATGATTGACCAG
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT4G01480.1 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GCACACTATGTGAAGACAATGACCCTATAGATGTTTTAGTTATCATGCAG GAGCCTGTGCTTCCGGGTTGTTTTCTTCGCGCCCGAGCTATTGGTTTAATGEST: gi|116470397|gb|EG512989.1|EG512989
genomic: GCACACTATGTGAAGACAATGACCCTATAGATGTTTTAGTTATCATGCAGgtttgagtct ... ttatgtacagGAGCCTGTGCTTCCGGGTTGTTTTCTTCGCGCCCGAGCTATTGGTTTAATG
EST: GCACACTATGTGAAGACAATGACCCTATAGATGTTTTAGTTATCATGCAG GAGCCTGTGCTTCCGGGTTGTTTTCTTCGCGCCCGAGCTATTGGTTTAATG
genomic: GCACACTATGTGAAGACAATGACCCTATAGATGTTTTAGTTATCATGCAGgtttgagtct ... ttatgtacagGAGCCTGTGCTTCCGGGTTGTTTTCTTCGCGCCCGAGCTATTGGTTTAATG
ccaaaagaaaatgaaatggctgaaataatttcttatcaaagttgattatgtacagGAGCCTGTGCTTCCGGGTTGTTTTCTTCGCGCCCGAGCTATTGGTTTAATGCCTATGATTGACCAG
agttgat putative branch site (score: 5)
aaataatttcttatca TA-rich tract