1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
gtaagttacacgaaccttttctcaactacttagaatgctgagattgttttatacgataatttggtgtgtaactaactgttggatattgaattgaatcataatgcagGAGGATGGAGAATAGCTTGAAGGAAGAACTGTTTATGTTGTTGTTTTCTTCTCTATATCCAGTTTTGTTACCTGTTTTTATTGTACTCTGTGGGAGGGCT
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT2G18110.1 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TCAATGAATATGTCCAGAGCTGTGACATTGTTGCCTTCAACAAGATAT GAGGATGGAGAAEST: gi|86079763|gb|DR375520.1|DR375520
genomic: TCAATGAATATGTCCAGAGTTGTGACATTGTTGCCTTCAACAAGATATgtaagttaca ... cataatgcagGAGGATGGAGAA
EST: GATCAATGAATATGTCCAGAGTTGTGACATTGTTGCCTTCAACAAGATAT GAGGATGGAGAATAGCTTGAAGGAAGAACTGTTTATGTTGTTGTTTTCTTCEST: gi|116457587|gb|EG500179.1|EG500179
genomic: GATCAATGAATATGTCCAGAGTTGTGACATTGTTGCCTTCAACAAGATATgtaagttaca ... cataatgcagGAGGATGGAGAATAGCTTGAAGGAAGAACTGTTTATGTTGTTGTTTTCTTC
EST: GATCAATGAATATGTCCAGAGTTGTGACATTGTTGCCTTCAACAAGATAT GAGGATGGAGAATAGCTTGAAGGAAGAACTGTTTATGTTGTTGTTTTEST: gi|124737193|gb|EH828595.1|EH828595
genomic: GATCAATGAATATGTCCAGAGTTGTGACATTGTTGCCTTCAACAAGATATgtaagttaca ... cataatgcagGAGGATGGAGAATAGCTTGAAGGAAGAACTGTTTATGTTGTTGTTTT
EST: GATCAATGAATATGTCCAGAGTTGTGACATTGTTGCCTTCAACAAGATAT GAGGATGGAGAATAGCTTGAAGGAAGAACTGTTTATGTTG
genomic: GATCAATGAATATGTCCAGAGTTGTGACATTGTTGCCTTCAACAAGATATgtaagttaca ... cataatgcagGAGGATGGAGAATAGCTTGAAGGAAGAACTGTTTATGTTG
tacgataatttggtgtgtaactaactgttggatattgaattgaatcataatgcagGAGGATGGAGAATAGCTTGAAGGAAGAACTGTTTATGTTGTTGTTTTCTTCTCTATATCCAGTTTTGTTACCTGTTTTTATTGTACTCTGTGGGAGGGCT
aactaac putative branch site (score: 1)
atattgaattgaat TA-rich tract