1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
gttggtttttctaaacaagaacgtacccttaaatactcgagagagaaccgttattaactaggtctaaaccaaatcttggttttgttgcagATATATGCAATGCCGGTATTTGATATGATGGAGACTTTATTGGTCAAGAAGCTAAATTTCAGACCAACCACAACTCTTCGGTTCTTTGTCCGTAATTTCT
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT5G40780.2 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TCGCCACGGCGAACATCTTCGTCGTGATCCATGTCATTGGTAGTTACCAG ATATATGCAATGCCGGTEST: gi|125207856|gb|EL222810.1|EL222810
genomic: TCGCCACGGCGAACATCTTCGTCGTGATCCATGTCATTGGTAGTTACCAGgttggttttt ... tttgttgcagATATATGCAATGCCGGT
EST: ATCTTCGTCGTGATCCATGTCATTGGTAGTTACCAG ATATATGCAATGCCGGTATTTGATATGATGGAGACTTTATTGGTCAAGAAGEST: gi|86086870|gb|DR382629.1|DR382629
genomic: ATCTTCGTCGTGATCCATGTCATTGGTAGTTACCAGgttggttttt ... tttgttgcagATATATGCAATGCCGGTATTTGATATGATGGAGACTTTATTGGTCAAGAAG
EST: TTCGTCGTGATCCATGTCATTGGTAGTTACCAG ATATATGCAATGCCGGTATTTGATATGATGGAGACTTTATTGGTCAAGAAGEST: gi|124878905|gb|EH958342.1|EH958342
genomic: TTCGTCGTGATCCATGTCATTGGTAGTTACCAGgttggttttt ... tttgttgcagATATATGCAATGCCGGTATTTGATATGATGGAGACTTTATTGGTCAAGAAG
EST: CGCCACGGCGAACATCTTCGTCGTGATCCATGTCATTGGTAGTTAACCAG ATATATGCAATGCCGGTATT
genomic: CGCCACGGCGAACATCTTCGTCGTGATCCATGTCATTGGTAGTTA-CCAGgttggttttt ... tttgttgcagATATATGCAATGCCGGTATT
ctcgagagagaaccgttattaactaggtctaaaccaaatcttggttttgttgcagATATATGCAATGCCGGTATTTGATATGATGGAGACTTTATTGGTCAAGAAGCTAAATTTCAGACCAACCACAACTCTTCGGTTCTTTGTCCGTAATTTCT
ttttgtt CT-rich tract
ttattaacta TA-rich tract