1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtaagataaagaccactcctttactggcatattgatacagagtgcggtttttaatctgtgatctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGACTTTGATTGAAGCCCATGTCGATGTGAAAACCACAGACGGCTACACCT
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT4G34670.1 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTCGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGEST: gi|86054239|gb|DR349996.1|DR349996
genomic: TCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGT-GTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATATGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054283|gb|DR350040.1|DR350040
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATATGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054294|gb|DR350051.1|DR350051
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATNGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGEST: gi|86054257|gb|DR350014.1|DR350014
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054264|gb|DR350021.1|DR350021
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054274|gb|DR350031.1|DR350031
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTASAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACEST: gi|86054293|gb|DR350050.1|DR350050
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGAC
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054267|gb|DR350024.1|DR350024
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054247|gb|DR350004.1|DR350004
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|125145890|gb|EL181058.1|EL181058
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: AATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054252|gb|DR350009.1|DR350009
genomic: AATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGGTGAWGAAGTGGCAEST: gi|86054250|gb|DR350007.1|DR350007
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGG-TGAAGAAGTGGCA
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054270|gb|DR350027.1|DR350027
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATATGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|164010004|gb|ES017288.1|ES017288
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGEST: gi|86054281|gb|DR350038.1|DR350038
genomic: GACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|164204917|gb|ES167944.1|ES167944
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054284|gb|DR350041.1|DR350041
genomic: GTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATATGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054242|gb|DR349999.1|DR349999
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGNCAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054272|gb|DR350029.1|DR350029
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCA-A-CCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAEST: gi|86054277|gb|DR350034.1|DR350034
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCA
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAEST: gi|86054289|gb|DR350046.1|DR350046
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGA
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|164208997|gb|ES130424.1|ES130424
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGEST: gi|86054249|gb|DR350006.1|DR350006
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATATGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054259|gb|DR350016.1|DR350016
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054233|gb|DR349990.1|DR349990
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAGGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054296|gb|DR350053.1|DR350053
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGEST: gi|86054240|gb|DR349997.1|DR349997
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054254|gb|DR350011.1|DR350011
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTRG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTCGCAGEST: gi|86054285|gb|DR350042.1|DR350042
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054280|gb|DR350037.1|DR350037
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054241|gb|DR349998.1|DR349998
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054263|gb|DR350020.1|DR350020
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGTAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054256|gb|DR350013.1|DR350013
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGTGTGAAEST: gi|86054282|gb|DR350039.1|DR350039
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTG-GTGAA
EST: GTCTTAGAGCTGAGGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054271|gb|DR350028.1|DR350028
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGCAAGAAGTGGCAEST: gi|86054258|gb|DR350015.1|DR350015
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTG-AAGAAGTGGCA
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054287|gb|DR350044.1|DR350044
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCASTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTEST: gi|86054253|gb|DR350010.1|DR350010
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCT
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|164054042|gb|ES069201.1|ES069201
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: ATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054295|gb|DR350052.1|DR350052
genomic: ATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054279|gb|DR350036.1|DR350036
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCA-A-CCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054236|gb|DR349993.1|DR349993
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054297|gb|DR350054.1|DR350054
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATATGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054288|gb|DR350045.1|DR350045
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATATGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCEST: gi|86054251|gb|DR350008.1|DR350008
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTC
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054248|gb|DR350005.1|DR350005
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCA-A-CCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|164080636|gb|ES097475.1|ES097475
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: TGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGATGTGGCAGEST: gi|86054266|gb|DR350023.1|DR350023
genomic: TGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054290|gb|DR350047.1|DR350047
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATATGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|164043382|gb|ES154054.1|ES154054
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: CCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054243|gb|DR350000.1|DR350000
genomic: CCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054246|gb|DR350003.1|DR350003
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054273|gb|DR350030.1|DR350030
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATATGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054265|gb|DR350022.1|DR350022
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCA-A-CCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054268|gb|DR350025.1|DR350025
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAEST: gi|86054235|gb|DR349992.1|DR349992
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTT-CACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCA
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATATGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGTSAEST: gi|86054244|gb|DR350001.1|DR350001
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGC-A
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054260|gb|DR350017.1|DR350017
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054237|gb|DR349994.1|DR349994
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054262|gb|DR350019.1|DR350019
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054234|gb|DR349991.1|DR349991
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGEST: gi|86054286|gb|DR350043.1|DR350043
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
EST: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGG GGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
genomic: GTCTTAGAGCTGAAGATGTTCAGGGAAGGAATGTGTTGACCCAGTTCTGGgtaagataaa ... atctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAG
ctcctttactggcatattgatacagagtgcggtttttaatctgtgatctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGACTTTGATTGAAGCCCATGTCGATGTGAAAACCACAGACGGCTACACCT
ttttaat putative branch site (score: 3)
tctctgt putative PPT
tttttaatct TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| gtaagataaagaccactcctttactggcatattgatacagagtgcggtttttaatctgtgatctctgtagGGTATGGATTTCACAACCGACAAGCTAAGGTCATTGGTGAAGAAGTGGCAGACTTTGATTGAAGCCCATGTCGATGTGAAAACCACAGACGGCTACACCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGAAGC